RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 LY96Q9Y6Y9 160 aa3.96□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 NUPR1O60356 82 aa3.95□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 C3orf79P0CE67 100 aa3.95□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 COX8AP10176 69 aa3.95□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 BLCAPP62952 87 aa3.95□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 LAIR2Q6ISS4 152 aa3.95□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 LINC01600Q96MT4 127 aa3.95□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 UPK3BQ9BT76 320 aa3.95□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 TAS2R4Q9NYW5 299 aa3.95□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 U3KQK5 164 aa3.95□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.95□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 CKS2P33552 79 aa3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 RPS27P42677 84 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 REG3AQ06141 175 aa3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 SS18Q15532 418 aa3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 BAGE3Q86Y29 109 aa3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 BAGE2Q86Y30 109 aa3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 Q8N8P6 123 aa3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 RMI2Q96E14 147 aa3.94□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 IQCF6A8MYZ5 107 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 COX7A1P24310 79 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 HERVK_113P61574 105 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 FAM27BQ5VT28 67 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 NDUFA11Q86Y39 141 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 MUC7Q8TAX7 377 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 AQP3Q92482 292 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 ODF3Q96PU9 254 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 OSTCQ9NRP0 149 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 LHFPL6Q9Y693 200 aa3.93□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa3.92□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.92□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 K7EQG2 157 aa3.92□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 SERF1AO75920 110 aa3.92□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 TSHBP01222 138 aa3.92□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 INSL4Q14641 139 aa3.92□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.92□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 NRACQ8N912 160 aa3.92□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 Q96M85 177 aa3.92□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.92□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 LINC01548A6NM66 108 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 F2Z2F3 143 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 PEX7O00628 323 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 NDUFC1O43677 76 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 IGLV2-8P01709 118 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-48P01763 117 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 CCKP06307 115 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 CCL3L1P16619 93 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 CD24P25063 80 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 SMIM11AP58511 58 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 FXYD6P3P58550 94 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 DEFB136Q30KP8 78 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 DAND5Q8N907 189 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 GAFA1Q96PS6 74 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 HIGD1BQ9P298 99 aa3.91□□□□□ -1.78
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.9□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 A0A087X002 238 aa3.9□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 A6NDX4 124 aa3.9□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 C3orf84H3BNL1 204 aa3.9□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 BMPR1BO00238 502 aa3.9□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 PIPP12273 146 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 GNB1P62873 340 aa3.9□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.9□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00643Q86TS7 51 aa3.9□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 PDPNQ86YL7 162 aa3.9□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.9□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.9□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.9□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.89□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 BCE1O60756 84 aa3.89□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 APCSP02743 223 aa3.89□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.89□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.89□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 ZFP2Q6ZN57 461 aa3.89□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.89□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 CLEC7AQ9BXN2 247 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms