RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551887.2

ITGB7-211, Transcript of integrin subunit beta 7, humanhuman

TSL 4

Gene ITGB7, Length 760 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7-211ENST00000551887 FAM223BA6NKX1 122 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 SH2D1AO60880 128 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 IGHV1-46P01743 117 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 IGHV3-13P01766 116 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 Q6ZR03 302 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 CYYR1Q96J86 154 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 Q96M66 194 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 A0A096LNJ9 63 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 IGKV1-5P01602 117 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 LINC01554Q52M75 96 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 GPHB5Q86YW7 130 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa5.05□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 A0A087WZ39 114 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 TRBV12-3P01733 135 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 IGHV3-30P01768 117 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 PRM2P04554 102 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 LINC00313P59037 77 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 FXYD4P59646 89 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 Q1RN00 199 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 LINC00114Q6XXX2 140 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 PRR25Q96S07 402 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 DOCK11Q5JSL3 2073 aa5.03□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 ZNF815PA8K554 130 aa5.03□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 F8VRH5 84 aa5.03□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 K7EMI3 77 aa5.03□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 CD28P10747 220 aa5.03□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 MIFP14174 115 aa5.03□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 C6orf99Q4VX62 202 aa5.03□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.03□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 PFN4Q8NHR9 129 aa5.03□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.03□□□□□ -1.6
ITGB7-211ENST00000551887 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.02□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.02□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 F8WEM9 126 aa5.02□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 COX7A2P2O60397 106 aa5.02□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 ZNF32P17041 273 aa5.02□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 KRTAP10-3P60369 221 aa5.02□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 DEFB112Q30KQ8 113 aa5.02□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 BRD3OSQ6XYD6 125 aa5.02□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 SCXQ7RTU7 201 aa5.02□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.02□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 A0A0J9YY99 117 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 A6NN06 94 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 SRRM5B3KS81 715 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 PPP1R17O96001 155 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 DNAL4O96015 105 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 IAPPP10997 89 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 ZNF138P52744 262 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 FHL1Q13642 323 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 C10orf128Q5T292 105 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 ITLN1Q8WWA0 313 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 RNF185Q96GF1 192 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 TMEM141Q96I45 108 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa5□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 CLPSL1A2RUU4 121 aa5□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 FAM27BQ5VT28 67 aa5□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 MORN5Q5VZ52 161 aa5□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 Q6YL49 198 aa5□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 ICOSQ9Y6W8 199 aa5□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 COL7A1Q02388 2944 aa4.99□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa4.99□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa4.99□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.99□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 M0R135 149 aa4.99□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 PRSS2P07478 247 aa4.99□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 IGKV1-13P0DP09 117 aa4.99□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 EDDM3BP56851 147 aa4.99□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 SFTA2Q6UW10 78 aa4.99□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 LINC01006Q8NI28 216 aa4.99□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.99□□□□□ -1.61
ITGB7-211ENST00000551887 RYR1P21817 5038 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms