RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 Q6ZN92 141 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 LEPROTL1O95214 131 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 AKR1D1P51857 326 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 C5orf52A6NGY3 159 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 GAGE6Q13070 117 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 TTC32Q5I0X7 151 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 Q9H8V8 135 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 IGIPA6NJ69 53 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 LINC00310P59036 64 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 RBX1P62877 108 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 SEC11AP67812 179 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 LCE1DQ5T752 114 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 VCX2Q9H322 139 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 TENM2Q9NT68 2774 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 A0A096LNJ9 63 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 RMI2Q96E14 147 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 NUPR1O60356 82 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 CRPP02741 224 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 PRSS1P07477 247 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 PMVKQ15126 192 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 PMCHL1Q16048 86 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 MIAQ16674 131 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 MPV17L2Q567V2 206 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 COX11Q9Y6N1 276 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 SS18Q15532 418 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 AMELXQ99217 191 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 PRR34Q9NV39 138 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-220ENST00000550700 C20orf202A1L168 122 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 IGHV3-30P01768 117 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 IGHV3-33P01772 117 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 FABP4P15090 132 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 REG3AQ06141 175 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 PET117Q6UWS5 81 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 NFE4Q86UQ8 179 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 Q8N976 141 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 CST9LQ9H4G1 147 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 KLK12Q9UKR0 248 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 IFITM10A6NMD0 228 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 LY6G6CO95867 125 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 BAALCQ8WXS3 180 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 TM2D2Q9BX73 214 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 HERVK_113P63121 156 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 Q6ZUT4 128 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 F8VRH5 84 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 PLNP26678 52 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 UBE2WQ96B02 151 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 H3BRM9 83 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 UBE2D1P51668 147 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 KRTDAPP60985 99 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.1 ms