RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 FXYD2P54710 66 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 Q8N976 141 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 F8WDY8 70 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 IGKV4-1P06312 121 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF580Q9UK33 172 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 SYCNQ0VAF6 134 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 CASC2Q6XLA1 102 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00643Q86TS7 51 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 ATRXP46100 2492 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 DEFB1P60022 68 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 C16orf95Q9H693 158 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 WISP2O76076 250 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 BRI3O95415 125 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 FOXI1Q12951 378 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 CLEC2BQ92478 149 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 KLLNB2CW77 178 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 IGLV2-8P01709 118 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 M0R378 163 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 DCANP1Q8TF63 244 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 NUPR1O60356 82 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 TCL1BO95988 128 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 C5orf47Q569G3 176 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 C9orf85Q96MD7 179 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 PRR15LQ9BU68 103 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 CRIP1P50238 77 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFC1O43677 76 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 K7ERS5 55 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 WFDC2Q14508 124 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 RNF185Q96GF1 192 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 USP17L23D6RBM5 183 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 G3V4G9 280 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 NRACQ8N912 160 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-226ENST00000546160 C10orf142B7Z368 130 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 TAX1BP3O14907 124 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 Q8IZM0 81 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 CNFNQ9BYD5 112 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 A0A0J9YWU9 116 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 RBX1P62877 108 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 LY6G6CO95867 125 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 Q6ZPA2 131 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 J3KT08 172 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 TSHBP01222 138 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 CACNA1AO00555 2505 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 IGLV2-11P01706 119 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 UBE2D3P61077 147 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 V9GYY9 64 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 C10orf25Q5T742 122 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-226ENST00000546160 IGLV1-51P01701 117 aa4.68□□□□□ -1.66
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