RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-205ENST00000528462 TTC32Q5I0X7 151 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-205ENST00000528462 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-205ENST00000528462 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-205ENST00000528462 KMT2AQ03164 3969 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 LCE6AA0A183 80 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM19A2Q8N3H0 131 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM104AQ969W3 186 aa14.88□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 ANGP03950 147 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF664Q8N3J9 261 aa14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM141Q96I45 108 aa14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 SCGB3A1Q96QR1 104 aa14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 PRR34Q9NV39 138 aa14.87□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa14.86□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 KLK12Q9UKR0 248 aa14.86□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.85□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa14.85□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 S100A6P06703 90 aa14.85□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa14.85□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 Q6ZUT4 128 aa14.85□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP5LO75964 103 aa14.84□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 Q6ZR54 194 aa14.84□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 LINC00269Q8N2A0 174 aa14.84□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PACSIN3-205ENST00000528462 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAH6Q9C0G6 4158 aa14.83□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 LEPROTL1O95214 131 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 REG3AQ06141 175 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 ENHOQ6UWT2 76 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 Q6ZN92 141 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 AMELXQ99217 191 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 SACSQ9NZJ4 4579 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.81□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 MIAQ16674 131 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 UBE2WQ96B02 151 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 VCX2Q9H322 139 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 HSPB8Q9UJY1 196 aa14.8□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 C5orf52A6NGY3 159 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 CRPP02741 224 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 TEX43Q6ZNM6 134 aa14.79□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 LINC00173Q6ZV60 143 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 HIST3H2BBQ8N257 126 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 IFI27L1Q96BM0 104 aa14.78□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa14.77□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 CCL25O15444 150 aa14.77□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 BAALCQ8WXS3 180 aa14.77□□□□□ -0.04
PACSIN3-205ENST00000528462 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 CLPSL2Q6UWE3 100 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 C2orf88Q9BSF0 95 aa14.76□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 M0R2N4 97 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 FABP4P15090 132 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 PMVKQ15126 192 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 CST9LQ9H4G1 147 aa14.75□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 IFITM10A6NMD0 228 aa14.74□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 NFE4Q86UQ8 179 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 S100A2P29034 98 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 UBE2D1P51668 147 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 RMI2Q96E14 147 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 Q9HAA7 133 aa14.73□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 SS18Q15532 418 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 COX11Q9Y6N1 276 aa14.72□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 PRSS1P07477 247 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 C1orf43Q9BWL3 253 aa14.71□□□□□ -0.05
PACSIN3-205ENST00000528462 C6orf223Q8N319 242 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.7□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 TM2D2Q9BX73 214 aa14.69□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 SEC11AP67812 179 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 LINC00242Q5T6M2 205 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 DNAH2Q9P225 4427 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 CD164L2Q6UWJ8 174 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 XCL1P47992 114 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-205ENST00000528462 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-205ENST00000528462 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-205ENST00000528462 ODF1Q14990 250 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-205ENST00000528462 C3orf79P0CE67 100 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-205ENST00000528462 HERVK_113P63121 156 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-205ENST00000528462 FOXI1Q12951 378 aa14.64□□□□□ -0.07
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