RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 Q6ZUT4 128 aa10.65□□□□□ -0.71
TRPS1-206ENST00000517323 ATOH7Q8N100 152 aa10.65□□□□□ -0.71
TRPS1-206ENST00000517323 MIEN1Q9BRT3 115 aa10.65□□□□□ -0.71
TRPS1-206ENST00000517323 UBE2L6O14933 153 aa10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-206ENST00000517323 CLPSL2Q6UWE3 100 aa10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-206ENST00000517323 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-206ENST00000517323 PRSS29PA6NIE9 313 aa10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-206ENST00000517323 H3BNG1 76 aa10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-206ENST00000517323 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-206ENST00000517323 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa10.63□□□□□ -0.71
TRPS1-206ENST00000517323 PRSS1P07477 247 aa10.63□□□□□ -0.71
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TRPS1-206ENST00000517323 TCTAP57738 103 aa10.61□□□□□ -0.71
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TRPS1-206ENST00000517323 IGHV3-33P01772 117 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-206ENST00000517323 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-206ENST00000517323 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-206ENST00000517323 MAJINQ3KP22 176 aa10.6□□□□□ -0.71
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TRPS1-206ENST00000517323 DNAH10Q8IVF4 4471 aa10.58□□□□□ -0.72
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TRPS1-206ENST00000517323 TMEM141Q96I45 108 aa10.58□□□□□ -0.72
TRPS1-206ENST00000517323 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
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TRPS1-206ENST00000517323 ORAOV1Q8WV07 137 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 CHAC1Q9BUX1 264 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 C20orf202A1L168 122 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 SIVA1O15304 175 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-206ENST00000517323 REG3AQ06141 175 aa10.48□□□□□ -0.73
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