RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514275.5

IFT122-231, Transcript of intraflagellar transport 122, human

TSL 5

Gene IFT122, Length 296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT122-231	ENST00000514275	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TMEM238	C9JI98	176 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275		M0QXV9	152 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	NDUFA7	O95182	113 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	IGLV1-51	P01701	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	INSL3	P51460	131 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	COX6A2	Q02221	97 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275		Q6ZTI0	123 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275		Q6ZUT4	128 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TMEM101	Q96IK0	257 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275		A8MZ25	164 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275		J3QR89	54 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	NDUFA1	O15239	70 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	CIDEA	O60543	219 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	SPINK8	P0C7L1	97 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	IFITM1	P13164	125 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	FOXI1	Q12951	378 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	SFTA2	Q6UW10	78 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	MTURN	Q8N3F0	131 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	SIGMAR1	Q99720	223 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		3.54	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	GAGE12J	A6NER3	117 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275		K7EQD1	137 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	PRSS2	P07478	247 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	LINC00694	P0DN24	101 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	KRTAP10-3	P60369	221 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	GAGE4	Q13068	117 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	GAGE5	Q13069	117 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	MIA	Q16674	131 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	ZAN	Q9Y493	2812 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		3.53	□□□□□ -1.84
IFT122-231	ENST00000514275	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		3.52	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275		F5H768	121 aa		3.52	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275		H7C423	109 aa		3.52	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	SCGB1A1	P11684	91 aa		3.52	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	PLA2G2A	P14555	144 aa		3.52	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	HERVK_113	P63121	156 aa		3.52	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		3.52	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	FHL2	Q14192	279 aa		3.52	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	TEN1	Q86WV5	123 aa		3.52	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	C16orf74	Q96GX8	76 aa		3.52	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	SORL1	Q92673	2214 aa		3.52	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275		H7C2G1	150 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	TRIAP1	O43715	76 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	GAGE7	O76087	117 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	GAGE12F	P0CL80	117 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	GAGE12G	P0CL81	117 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	GAGE12I	P0CL82	117 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	HILS1	P60008	231 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	ATXN8	Q156A1	80 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	LINC01620	Q4KN68	170 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	TMEM243	Q9BU79	118 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	NACA	E9PAV3	2078 aa		3.51	□□□□□ -1.85
IFT122-231	ENST00000514275	PDZD2	O15018	2839 aa		3.5	□□□□□ -1.85

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