RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 SPINK8P0C7L1 97 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 RNF224P0DH78 156 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 NUPR1O60356 82 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 TSPAN13O95857 204 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 PRR9Q5T870 116 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 Q8N976 141 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 Q6ZUT4 128 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 DSCR8Q96T75 97 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 PFN2P35080 140 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 GAGE2BQ13066 116 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 LINC01620Q4KN68 170 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 GAGE2EQ4V326 116 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.22□□□□□ -1.73
POLK-215ENST00000514141 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.21□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 IMUPQ9GZP8 106 aa4.21□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 C9JAW5 83 aa4.21□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 KRTAP10-9P60411 292 aa4.21□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.21□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 RBX1P62877 108 aa4.21□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 M0R378 163 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 FHL2Q14192 279 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 ZNF124Q15973 351 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 ACACBO00763 2458 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 HIVEP2P31629 2446 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 ASPMQ8IZT6 3477 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 PCP2Q8IVA1 136 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 DAND5Q8N907 189 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.19□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 TAX1BP3O14907 124 aa4.19□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 CREBBPQ92793 2442 aa4.19□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 CDK2AP2O75956 126 aa4.19□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 XCL1P47992 114 aa4.19□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 MRAPQ8TCY5 172 aa4.19□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.19□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.19□□□□□ -1.744e-7■■■■□ 26.6
POLK-215ENST00000514141 LINC00315P59091 139 aa4.19□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.19□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.19□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 COX7BP24311 80 aa4.19□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 Q6ZS46 218 aa4.19□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 IGHV3-30P01768 117 aa4.18□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.18□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 SYCNQ0VAF6 134 aa4.18□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 MAJINQ3KP22 176 aa4.18□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 LINC00310P59036 64 aa4.18□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 DPH3Q96FX2 82 aa4.18□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 B9D2Q9BPU9 175 aa4.18□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 ESM1Q9NQ30 184 aa4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 CFAP54Q96N23 3096 aa4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 LINC00643Q86TS7 51 aa4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 AKAP6Q13023 2319 aa4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 IGHV3-33P01772 117 aa4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 SPTBN2O15020 2390 aa4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.17□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 PRYO14603 147 aa4.16□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 C5orf38Q86SI9 138 aa4.16□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 KLK12Q9UKR0 248 aa4.16□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 FAM208BQ5VWN6 2430 aa4.16□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 BCE1O60756 84 aa4.16□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 FXYD2P54710 66 aa4.16□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.16□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.16□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.16□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.16□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.15□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 ATOX1O00244 68 aa4.15□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 LST1O00453 97 aa4.15□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 Q6Q795 121 aa4.15□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.15□□□□□ -1.74
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