RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.55□□□□□ -1.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TIRAPP58753 221 aa8.53□□□□□ -1.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GAGE6Q13070 117 aa8.53□□□□□ -1.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LELP1Q5T871 98 aa8.53□□□□□ -1.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AMELXQ99217 191 aa8.53□□□□□ -1.04
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.53□□□□□ -1.04
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 NOTCH1P46531 2555 aa8.53□□□□□ -1.04
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A096LPF7 62 aa8.52□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 hDV102S1A0JD36 115 aa8.52□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 H3BRM9 83 aa8.52□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.52□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.52□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.52□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRO1933Q9H354 126 aa8.52□□□□□ -1.05
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCL25O15444 150 aa8.51□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HERVK_113P63121 156 aa8.51□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DEFA6Q01524 100 aa8.51□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.51□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.51□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLC3P0DOY3 106 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q6ZUT4 128 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NFE4Q86UQ8 179 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C11orf86A6NJI1 115 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NMUP48645 174 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SS18Q15532 418 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STPG4Q8N801 248 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DDTP30046 118 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A0J9YXV3 536 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COX8AP10176 69 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UBE2D1P51668 147 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCL18P55774 89 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAJINQ3KP22 176 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C14orf144Q96I85 54 aa8.47□□□□□ -1.05
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.46□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 E9PLD3 99 aa8.46□□□□□ -1.06
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.46□□□□□ -1.06
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 DLEU1O43261 78 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.44□□□□□ -1.06
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HOXC-AS2-201ENST00000513533 CRPP02741 224 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MPV17L2Q567V2 206 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LEPROTO15243 131 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SIVA1O15304 175 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TCTAP57738 103 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM223A0PJW6 202 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.41□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 REG3AQ06141 175 aa8.41□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ESRGQ1W209 222 aa8.41□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.41□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM104AQ969W3 186 aa8.41□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 J3QQQ9 107 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF815PA8K554 130 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 M0R143 59 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SFTA2Q6UW10 78 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KLK12Q9UKR0 248 aa8.39□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 K7EP13 123 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV3-30P01768 117 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV3-33P01772 117 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MIAQ16674 131 aa8.38□□□□□ -1.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.38□□□□□ -1.07
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