RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	UPK2	O00526	184 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	IGKV1D-12	P01611	117 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	PRR4	Q16378	134 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	MKX	Q8IYA7	352 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	BRK1	Q8WUW1	75 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	C16orf95	Q9H693	158 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GFM2-208	ENST00000513331	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331		A0A1W2PQD3	144 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	IGHV3-33	P01772	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	SYNJ2BP	P57105	145 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	FGF12	P61328	243 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	PCBD1	P61457	104 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	SPTSSA	Q969W0	71 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	C16orf74	Q96GX8	76 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331		D6R8Y8	96 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	NDUFS5	O43920	106 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	SCRG1	O75711	98 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	IGHV3-23	P01764	117 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	DEFB134	Q4QY38	66 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	SFTA2	Q6UW10	78 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	RNF182	Q8N6D2	247 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	DAND5	Q8N907	189 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF714	Q96N38	554 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	SMR3A	Q99954	134 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331		Q9H3A6	140 aa		3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF815P	A8K554	130 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331		F8VRH5	84 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	C19orf84	I3L1E1	186 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	COX6C	P09669	75 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	CKS2	P33552	79 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	ERCC8	Q13216	396 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	JMJD1C	Q15652	2540 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	WDR86	Q86TI4	376 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	CCL17	Q92583	94 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF799	Q96GE5	643 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	COX14	Q96I36	57 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM243	Q9BU79	118 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	COL6A5	A8TX70	2615 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	ABCA4	P78363	2273 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331		A0A0J9YY99	117 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	C17orf98	A8MV24	154 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	UBE2L6	O14933	153 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	BCE1	O60756	84 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	IGLV1-47	P01700	117 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	IGHV3-30	P01768	117 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	TCRA	P04437	139 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	COX6B1	P14854	86 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	C10orf128	Q5T292	105 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331		Q6JHZ5	121 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331		Q86TA4	180 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	LINC00167	Q96N53	147 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GFM2-208	ENST00000513331	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		3.05	□□□□□ -1.92

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