RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 GAGE13Q4V321 117 aa7.63□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.63□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.63□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BRM9 83 aa7.62□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.62□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.62□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.61□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 A6NDN8 102 aa7.61□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 LEPROTO15243 131 aa7.61□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 FXYD2P54710 66 aa7.61□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6ZUT4 128 aa7.61□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 CEND1Q8N111 149 aa7.61□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.61□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 TGP01266 2768 aa7.6□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.6□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.6□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF815PA8K554 130 aa7.6□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2D1P51668 147 aa7.6□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 APOC4P55056 127 aa7.6□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 TIRAPP58753 221 aa7.6□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.6□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.6□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 LYRM9A8MSI8 78 aa7.59□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 J3QQQ9 107 aa7.59□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 K7EP13 123 aa7.59□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 GCSHP23434 173 aa7.59□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 MRAPQ8TCY5 172 aa7.59□□□□□ -1.19
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0J9YY99 117 aa7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 C9orf118A6NHY6 69 aa7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 H7C423 109 aa7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2V1Q13404 147 aa7.58□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM13P0DJ93 91 aa7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 DEFB130BP0DP73 79 aa7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 DEFB130AP0DP74 79 aa7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H4GQ99525 98 aa7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM243Q9BU79 118 aa7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 VWFP04275 2813 aa7.57□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1B0GWB2 263 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 DEFB135Q30KP9 77 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 Q8NAQ8 132 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF183Q96D59 192 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 A8MZ25 164 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 CCL25O15444 150 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 MIFP14174 115 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP10-11P60412 298 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 C12orf74Q32Q52 190 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 PTTG1IPP53801 180 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 COX6A2Q02221 97 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 VAMP3Q15836 100 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 PRO0255Q9UI72 69 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 NOTCH1P46531 2555 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BUT2 72 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 K7ERJ3 54 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-30P01768 117 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0J9YXY3 114 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 SPINK8P0C7L1 97 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 GYPEP15421 78 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 HERVK_113P63121 156 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB37Q96AX2 223 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PPM0 123 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLL5B9A064 214 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2L6O14933 153 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 DEFB4AO15263 64 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 GAGE6Q13070 117 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM101Q96IK0 257 aa7.51□□□□□ -1.21
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