RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 PIN1P1O15428 100 aa-0.18□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 SPINK8P0C7L1 97 aa-0.18□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 SMCO1Q147U7 214 aa-0.18□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 TCEAL4Q96EI5 215 aa-0.18□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 DPH3Q96FX2 82 aa-0.18□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 CNFNQ9BYD5 112 aa-0.18□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-0.18□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 NPVFQ9HCQ7 196 aa-0.18□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.18□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 CSMD3Q7Z407 3707 aa-0.18□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 REV3LO60673 3130 aa-0.18□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-0.18□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 NWD2Q9ULI1 1742 aa-0.18□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 CUBNO60494 3623 aa-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 AKAP6Q13023 2319 aa-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 SPEGQ15772 3267 aa-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 SPEF2Q9C093 1822 aa-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 CCL18P55774 89 aa-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 LELP1Q5T871 98 aa-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 LINC00846Q9NV44 126 aa-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 SCN3BQ9NY72 215 aa-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 IFT140Q96RY7 1462 aa-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.2□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.2□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 PRDM2Q13029 1718 aa-0.2□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 HCG22E2RYF7 251 aa-0.2□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 M0R3E3 92 aa-0.2□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 SIX6O95475 246 aa-0.2□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 PPP1R17O96001 155 aa-0.2□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 PFDN5Q99471 154 aa-0.2□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 PDCD10Q9BUL8 212 aa-0.2□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 CCDC167Q9P0B6 97 aa-0.2□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 TACC2O95359 2948 aa-0.2□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 NF1P21359 2839 aa-0.2□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 NHSL1Q5SYE7 1610 aa-0.2□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 MYH8P13535 1937 aa-0.21□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-0.21□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 PXDNQ92626 1479 aa-0.21□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 NBEAQ8NFP9 2946 aa-0.21□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 PLXNB2O15031 1838 aa-0.21□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 WNK3Q9BYP7 1800 aa-0.21□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-0.21□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 ARPC4P59998 168 aa-0.21□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 WFDC2Q14508 124 aa-0.21□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 C10orf128Q5T292 105 aa-0.21□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 LYSTQ99698 3801 aa-0.21□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 FAM186AA6NE01 2351 aa-0.21□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 ZNF609O15014 1411 aa-0.21□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-0.22□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 MRC1P22897 1456 aa-0.22□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 MUC3AQ02505 3323 aa-0.22□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 A0A0C4DFX4 3053 aa-0.22□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.22□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-0.22□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 M0R135 149 aa-0.22□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 BCE1O60756 84 aa-0.22□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.22□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa-0.22□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 R4GMQ9 66 aa-0.22□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-0.22□□□□□ -2.44
RBM39-242ENST00000498280 VCANP13611 3396 aa-0.22□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.22□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 GRIN2AQ12879 1464 aa-0.22□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 PLCE1Q9P212 2302 aa-0.22□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 EYSQ5T1H1 3165 aa-0.22□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 BICRAQ9NZM4 1560 aa-0.23□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 LAMC1P11047 1609 aa-0.23□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-0.23□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-0.23□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-0.23□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 HAMPP81172 84 aa-0.23□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 Q8N8P6 123 aa-0.23□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 AQP10Q96PS8 301 aa-0.23□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 PATJQ8NI35 1801 aa-0.23□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 DOCK1Q14185 1865 aa-0.23□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 PCNTO95613 3336 aa-0.23□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 SZT2Q5T011 3432 aa-0.23□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.23□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-0.24□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-0.24□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 SPAG11BQ08648 103 aa-0.24□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 SPAG11AQ6PDA7 123 aa-0.24□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 TTC9CQ8N5M4 171 aa-0.24□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-0.24□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 CFTRP13569 1480 aa-0.24□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 MTORP42345 2549 aa-0.24□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 LRP6O75581 1613 aa-0.24□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
RBM39-242ENST00000498280 GNG7O60262 68 aa-0.25□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.2 ms