RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.86□□□□□ -0.83
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NISCH-212ENST00000488380 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 H3BUA1 57 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 USP24Q9UPU5 2620 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 B4DSR2 109 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
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NISCH-212ENST00000488380 KNCNA6PVL3 124 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 DCANP1Q8TF63 244 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 PSMB8P28062 276 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
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NISCH-212ENST00000488380 J3KT08 172 aa9.83□□□□□ -0.84
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NISCH-212ENST00000488380 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.82□□□□□ -0.84
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NISCH-212ENST00000488380 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.82□□□□□ -0.84
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NISCH-212ENST00000488380 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.81□□□□□ -0.84
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NISCH-212ENST00000488380 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.79□□□□□ -0.84
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NISCH-212ENST00000488380 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.73□□□□□ -0.852e-6■□□□□ 11.3
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NISCH-212ENST00000488380 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.72□□□□□ -0.85
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