RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475336.5

TNIK-211, Transcript of TRAF2 and NCK interacting kinase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIK, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIK-211ENST00000475336 CDSNQ15517 529 aa7.16□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 TMEM141Q96I45 108 aa7.16□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 TMEM178BH3BS89 294 aa7.16□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 PSPHP1O15172 72 aa7.16□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 ATP6V0E1O15342 81 aa7.16□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 EBI3Q14213 229 aa7.16□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.16□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 C20orf173Q96LM9 149 aa7.16□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 Q9UF83 564 aa7.16□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 C5orf67F2Z3F1 127 aa7.16□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 CFHR3Q02985 330 aa7.16□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.16□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.16□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 MIAQ16674 131 aa7.15□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa7.15□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 BUB3O43684 328 aa7.15□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 UPK3BQ9BT76 320 aa7.15□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.15□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 U3KQA8 63 aa7.15□□□□□ -1.26
TNIK-211ENST00000475336 MUC3AQ02505 3323 aa7.15□□□□□ -1.27
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TNIK-211ENST00000475336 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.14□□□□□ -1.27
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TNIK-211ENST00000475336 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.14□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 IGIPA6NJ69 53 aa7.14□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 COX7A2LO14548 114 aa7.14□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 A0A087WYN8 130 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 LHBP01229 141 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 UBL5Q9BZL1 73 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 LTBP2Q14767 1821 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 ACANP16112 2415 aa7.13□□□□□ -1.27
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TNIK-211ENST00000475336 CRYGAP11844 174 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 XCL1P47992 114 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 XCL2Q9UBD3 114 aa7.13□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 SIRPDQ9H106 197 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 C5orf38Q86SI9 138 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 Q5XG85 94 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 Q6ZTI0 123 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.12□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.11□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.11□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.11□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 UBE2L6O14933 153 aa7.11□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 IMUPQ9GZP8 106 aa7.11□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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TNIK-211ENST00000475336 Q8N9L7 120 aa7.09□□□□□ -1.27
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TNIK-211ENST00000475336 TIMM17AQ99595 171 aa7.09□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.09□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.09□□□□□ -1.27
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TNIK-211ENST00000475336 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.09□□□□□ -1.27
TNIK-211ENST00000475336 A8MTW9 85 aa7.08□□□□□ -1.28
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TNIK-211ENST00000475336 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.08□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.08□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.08□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.08□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.08□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 A0A096LPF7 62 aa7.08□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.08□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 C9orf85Q96MD7 179 aa7.07□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.07□□□□□ -1.28
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TNIK-211ENST00000475336 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.07□□□□□ -1.28
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TNIK-211ENST00000475336 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.06□□□□□ -1.28
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TNIK-211ENST00000475336 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.06□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 CELA1Q9UNI1 258 aa7.06□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 MDS2Q8NDY4 140 aa7.06□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 CNFNQ9BYD5 112 aa7.06□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.05□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.05□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 DCANP1Q8TF63 244 aa7.05□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.05□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.05□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 F8WDY8 70 aa7.05□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 IGLV1-44P01699 117 aa7.05□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.05□□□□□ -1.28
TNIK-211ENST00000475336 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.05□□□□□ -1.28
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