RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF56Q15929 161 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF212Q495C1 297 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLLU1Q5K131 121 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM101Q96IK0 257 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BIN3Q9NQY0 253 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EVI2AP22794 236 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTRLP40313 264 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RHOHQ15669 191 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BAALCQ8WXS3 180 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAT8Q9UHE5 227 aa5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NTF3P20783 257 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00315P59091 139 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 REG3AQ06141 175 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AP1S3Q96PC3 154 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 V9GYV3 84 aa5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMIM17P0DL12 118 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00694P0DN24 101 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CACNG7P62955 275 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6ZR54 194 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COMMD7Q86VX2 200 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OSTCQ9NRP0 149 aa5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIGD1CA8MV81 97 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A8MWL6 223 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F2Z2F3 143 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RTL8CO15255 209 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB4BP61018 213 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSKUQ8WUA8 353 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UPK3BQ9BT76 320 aa5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GAS8-AS1O95177 125 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-30P01768 117 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-33P01772 117 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADCYAP1P18509 176 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB5AP20339 215 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUP35Q8NFH5 326 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 M0QY20 66 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRGC1P0CF51 173 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2D3P61077 147 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2D2P62837 147 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNFNQ9BYD5 112 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1B0GUT8 65 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHOX2AO14813 284 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LELP1Q5T871 98 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GATD1Q8NB37 220 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 V9GYY9 64 aa5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM218A2RU14 115 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F8W036 122 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCR2O95944 276 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AMN1Q8IY45 258 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BORCS7Q96B45 105 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.51□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00862A6NCI5 91 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTC32Q5I0X7 151 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RASL11AQ6T310 242 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.5□□□□□ -1.53
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