RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 DEFB1P60022 68 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 PEMTQ9UBM1 199 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 DPH3Q96FX2 82 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 CNFNQ9BYD5 112 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 A0A0B4J2C4 111 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 COX6CP09669 75 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 TMEM258P61165 79 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 TOMM6Q96B49 74 aa6.3□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 OVOL1O14753 267 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 LINC00643Q86TS7 51 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 hADV29S1A0JD25 119 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 F6UB75 175 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 H7C423 109 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 K7EQG2 157 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.29□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 NRACQ8N912 160 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.28□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 ATOX1O00244 68 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 TRIAP1O43715 76 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 PF4P02776 101 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 CRYGDP07320 174 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 CXCL5P42830 114 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.27□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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LMO3-210ENST00000453727 LINC00477Q96M19 166 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 PRO0628Q9UI54 55 aa6.26□□□□□ -1.41
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LMO3-210ENST00000453727 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 COL6A5A8TX70 2615 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 MALP21145 153 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 PRR9Q5T870 116 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 JPT2Q9H910 190 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 VWFP04275 2813 aa6.26□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 STAB1Q9NY15 2570 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 C11orf86A6NJI1 115 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 J3QQQ9 107 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 C2orf48Q96LS8 159 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 DSCR8Q96T75 97 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.25□□□□□ -1.41
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LMO3-210ENST00000453727 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.25□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 A0A0J9YX75 114 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 ZNF575Q86XF7 245 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.24□□□□□ -1.41
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LMO3-210ENST00000453727 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 C5orf38Q86SI9 138 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.24□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 TMEM223A0PJW6 202 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 DEFB131AP59861 70 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 IGKV3-20P01619 116 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.23□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 KNCNA6PVL3 124 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 SEC61GP60059 68 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.22□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 LST1O00453 97 aa6.21□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 IGLV1-51P01701 117 aa6.21□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.21□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.21□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 CLEC2BQ92478 149 aa6.21□□□□□ -1.41
LMO3-210ENST00000453727 KLLNB2CW77 178 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 SPRY2O43597 315 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 OXTP01178 125 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 PRSS2P07478 247 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 RHOHQ15669 191 aa6.21□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 ZNF415Q09FC8 603 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.2□□□□□ -1.42
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