RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443120.5

ANKRD39-202, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD39, Length 4,965 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-202ENST00000443120 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39-202ENST00000443120 EBI3Q14213 229 aa11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39-202ENST00000443120 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39-202ENST00000443120 PCDH15Q96QU1 1955 aa11.47□□□□□ -0.57
ANKRD39-202ENST00000443120 LY6LH3BQJ8 138 aa11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39-202ENST00000443120 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
ANKRD39-202ENST00000443120 NDUFS5O43920 106 aa11.46□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 SPTSSBQ8NFR3 76 aa11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 K7EQG2 157 aa11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 NRGNQ92686 78 aa11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 NUP210LQ5VU65 1888 aa11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 WNK1Q9H4A3 2382 aa11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 SNURFQ9Y675 71 aa11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 TRAV7A0A075B6U4 112 aa11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 A8MZ25 164 aa11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa11.42□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 SHISA2Q6UWI4 295 aa11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 C2orf16Q68DN1 1984 aa11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 A6NDX4 124 aa11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 PRR9Q5T870 116 aa11.41□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 Q8NA96 180 aa11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39-202ENST00000443120 KLLNB2CW77 178 aa11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 SCXQ7RTU7 201 aa11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 POM121L12Q8N7R1 296 aa11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 LINC01548A6NM66 108 aa11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 MAP6D1Q9H9H5 199 aa11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 C6orf99Q4VX62 202 aa11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 C9orf85Q96MD7 179 aa11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 CRYGDP07320 174 aa11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 CCKP06307 115 aa11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 PPDPFQ9H3Y8 114 aa11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 PRO0255Q9UI72 69 aa11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 LYRM9A8MSI8 78 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 PRO3102Q9H379 93 aa11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 WISP2O76076 250 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 MIFP14174 115 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 Q6ZTI0 123 aa11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 PRO0461Q9UI25 63 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 CLPSL1A2RUU4 121 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 EML5Q05BV3 1969 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.35□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 Q8N6K4 173 aa11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 NCOR2Q9Y618 2525 aa11.34□□□□□ -0.59
ANKRD39-202ENST00000443120 PRORYQ9H606 182 aa11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 TANC2Q9HCD6 1990 aa11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 CCL18P55774 89 aa11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 KLK12Q9UKR0 248 aa11.33□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 A0A087WVE0 104 aa11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 PROK1P58294 105 aa11.32□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 LINC01546A6NGU7 62 aa11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 RPS28P62857 69 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 REG3AQ06141 175 aa11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 Q6ZQY7 126 aa11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 NAV3Q8IVL0 2385 aa11.31□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 PRR14LQ5THK1 2151 aa11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.3□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 LMO4P61968 165 aa11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 CRYGAP11844 174 aa11.29□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 PRO0628Q9UI54 55 aa11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 SORL1Q92673 2214 aa11.28□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.27□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.27□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 MUC7Q8TAX7 377 aa11.27□□□□□ -0.6
ANKRD39-202ENST00000443120 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39-202ENST00000443120 AMELXQ99217 191 aa11.27□□□□□ -0.61
ANKRD39-202ENST00000443120 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39-202ENST00000443120 Q6ZSV7 163 aa11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39-202ENST00000443120 LTBP2Q14767 1821 aa11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39-202ENST00000443120 ESM1Q9NQ30 184 aa11.26□□□□□ -0.61
ANKRD39-202ENST00000443120 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39-202ENST00000443120 COX17Q14061 63 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39-202ENST00000443120 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39-202ENST00000443120 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39-202ENST00000443120 H0Y9J4 135 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39-202ENST00000443120 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.25□□□□□ -0.61
ANKRD39-202ENST00000443120 SMIM1B2RUZ4 78 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.8 ms