RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ECSCRQ19T08 205 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 SERP2Q8N6R1 65 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 DPM3Q9P2X0 92 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 UPK3BQ9BT76 320 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 MED14OSP0DP75 135 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 RELNP78509 3460 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.15□□□□□ -1.42
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RABGEF1-203ENST00000439720 COX7A2LO14548 114 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 SPTBN2O15020 2390 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 CD28P10747 220 aa6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 C22orf24Q9Y442 160 aa6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.15□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNJ2BPP57105 145 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8N2B8 174 aa6.14□□□□□ -1.43
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RABGEF1-203ENST00000439720 LAMA5O15230 3695 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 Q9HAA7 133 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8N6K4 173 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL19Q99731 98 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 PRYO14603 147 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 PFN2P35080 140 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 FHL2Q14192 279 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 LRBAP50851 2863 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 M0QY20 66 aa6.12□□□□□ -1.43
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RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01560Q8TB33 94 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf85Q96MD7 179 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 MDFIQ99750 246 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 G3V318 75 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A096LNT2 108 aa6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6V0E1O15342 81 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00846Q9NV44 126 aa6.1□□□□□ -1.43
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RABGEF1-203ENST00000439720 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.1□□□□□ -1.43
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RABGEF1-203ENST00000439720 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8N9W7 124 aa6.09□□□□□ -1.43
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RABGEF1-203ENST00000439720 TIMM17BO60830 172 aa6.09□□□□□ -1.44
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RABGEF1-203ENST00000439720 TENM4Q6N022 2769 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.08□□□□□ -1.44
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RABGEF1-203ENST00000439720 SOCS3O14543 225 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.07□□□□□ -1.44
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RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFA1O15239 70 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 LY6HO94772 140 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 C20orf197Q8N268 126 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHG2P01859 326 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP10-9P60411 292 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 TNP2Q05952 138 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 ATRXP46100 2492 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV3-20P01619 116 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV12-3P01733 135 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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