RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432741.5

CCDC18-AS1-209, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC18-AS1, Length 535 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TNFSF18Q9UNG2 199 aa3.15□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.15□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 HERC2O95714 4834 aa3.15□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TMEM218A2RU14 115 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 GPX1P07203 203 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 HTN1P15515 57 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 CRISP2P16562 243 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 CSN1S1P47710 185 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 SERF2P84101 59 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 KHDC3LQ587J8 217 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 ZNF767PQ75MW2 155 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 OR2T35Q8NGX2 323 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TIMM17AQ99595 171 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 VGLL1Q99990 258 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 LINC00467Q9BRT7 94 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 OTORQ9NRC9 128 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 RBAKDNA6NC62 111 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 UBE2L6O14933 153 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 GAS8-AS1O95177 125 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 DEFB130BP0DP73 79 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 DEFB130AP0DP74 79 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 ATP6V0CP27449 155 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 GNG4P50150 75 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 POM121L12Q8N7R1 296 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 OR10D4PQ8NGN7 298 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 C16orf74Q96GX8 76 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 ZNF492Q9P255 531 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 LENEPQ9Y5L5 61 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 C7orf71A4D174 169 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 G3V3Q6 166 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 P0DMU3 169 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 FAM231AP0DMU4 169 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 FAM231CP0DMU5 169 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 HTN3P15516 51 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 MT3P25713 68 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 NDUFA6P56556 154 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TOMM6Q96B49 74 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 HYLS1Q96M11 299 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 CYTL1Q9NRR1 136 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 HSPG2P98160 4391 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 HMSDA8MTL9 139 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 KRBOX1C9JBD0 128 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 COX7A2LO14548 114 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 SPINK4O60575 86 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 GCHFRP30047 84 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TWIST1Q15672 202 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 Q6ZQT7 251 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 CMTM2Q8TAZ6 248 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 C18orf15Q96N68 181 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 MUC4Q99102 2169 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 A0A0D9SG52 128 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 A8MUN3 132 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 H3BNG1 76 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 J3QQQ9 107 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 LST1O00453 97 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 NCR2O95944 276 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 IGLV2-11P01706 119 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TCRAP04437 139 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 LINC00313P59037 77 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TMEM241Q24JQ0 296 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 TDRG1Q3Y452 100 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-209ENST00000432741 PRR9Q5T870 116 aa3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms