RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 TGFAP01135 160 aa12.21□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 C2orf82Q6UX34 121 aa12.21□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa12.2□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM86BQ8N661 226 aa12.2□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 IL17DQ8TAD2 202 aa12.2□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 LINC01587Q99440 93 aa12.2□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 NACAE9PAV3 2078 aa12.2□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 GAGE2BQ13066 116 aa12.19□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 GAGE2EQ4V326 116 aa12.19□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa12.19□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 DYNLRB2Q8TF09 96 aa12.19□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 GAGE2DQ9UEU5 116 aa12.19□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
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HCLS1-202ENST00000428394 ACYP1P07311 99 aa12.18□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 HERV-K104P63124 156 aa12.18□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 ANAPC13Q9BS18 74 aa12.18□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 AKAP6Q13023 2319 aa12.18□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa12.18□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 H7C423 109 aa12.18□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 SLURP1P55000 103 aa12.18□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 PROK1P58294 105 aa12.18□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 DEFB114Q30KQ6 69 aa12.17□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM101Q96IK0 257 aa12.17□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 Q6ZSN1 163 aa12.16□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa12.16□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa12.16□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 CSMD1Q96PZ7 3565 aa12.15□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.15□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa12.15□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 IGHV4-31P0DP07 118 aa12.15□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
HCLS1-202ENST00000428394 PF4P02776 101 aa12.14□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 OTOGQ6ZRI0 2925 aa12.14□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 TRAV4A0A0B4J268 109 aa12.13□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 COX7A2LO14548 114 aa12.13□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 HTN1P15515 57 aa12.13□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 LINC00308Q8TCZ7 52 aa12.13□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa12.13□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 TRACP01848 142 aa12.13□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 LINC00242Q5T6M2 205 aa12.13□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 APCP25054 2843 aa12.12□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa12.12□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 K7EQD1 137 aa12.12□□□□□ -0.47
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HCLS1-202ENST00000428394 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
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HCLS1-202ENST00000428394 SHISA2Q6UWI4 295 aa12.11□□□□□ -0.47
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HCLS1-202ENST00000428394 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 TTC32Q5I0X7 151 aa12.1□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 OVOL2Q9BRP0 275 aa12.1□□□□□ -0.47
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HCLS1-202ENST00000428394 Q9H8V8 135 aa12.1□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 C15orf53Q8NAA6 179 aa12.09□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 FAM110AQ9BQ89 295 aa12.09□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 STHQ8IWL8 128 aa12.09□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
HCLS1-202ENST00000428394 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa12.08□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP10-9P60411 292 aa12.07□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 DEFB136Q30KP8 78 aa12.07□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 ODF3L2Q3SX64 289 aa12.07□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 ITPR3Q14573 2671 aa12.07□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 SPG11Q96JI7 2443 aa12.06□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa12.06□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 C1orf158Q8N1D5 194 aa12.06□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 CLEC2BQ92478 149 aa12.06□□□□□ -0.48
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HCLS1-202ENST00000428394 Q9UF83 564 aa12.06□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 F5H768 121 aa12.05□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 NRGNQ92686 78 aa12.05□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 ZFHX3Q15911 3703 aa12.05□□□□□ -0.48
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HCLS1-202ENST00000428394 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa12.05□□□□□ -0.48
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HCLS1-202ENST00000428394 C18orf65Q6ZTR6 163 aa12.05□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 PRIMA1Q86XR5 153 aa12.05□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM243Q9BU79 118 aa12.05□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC168Q8NDH2 2452 aa12.04□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 MTORP42345 2549 aa12.04□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 GAGE12JA6NER3 117 aa12.04□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 GAGE7O76087 117 aa12.04□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 GAGE12FP0CL80 117 aa12.04□□□□□ -0.48
HCLS1-202ENST00000428394 GAGE12GP0CL81 117 aa12.04□□□□□ -0.48
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