RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa13.57□□□□□ -0.24
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SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF415Q09FC8 603 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CHCHD7Q9BUK0 85 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SPINK8P0C7L1 97 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 LITAFQ99732 161 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 XGP55808 180 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 NPC2P61916 151 aa13.56□□□□□ -0.24
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SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFA12Q9UI09 145 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GV72 72 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZSV7 163 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZUT4 128 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CRYBA4P53673 196 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00467Q9BRT7 94 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CIDEAO60543 219 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 A8MTW9 85 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CKS1BP61024 79 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP6D1Q9H9H5 199 aa13.53□□□□□ -0.24
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SH3BP1-202ENST00000417536 ATRQ13535 2644 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 VSIG2Q96IQ7 327 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa13.52□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SPANXA1Q9NS26 97 aa13.52□□□□□ -0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 DYNLRB2Q8TF09 96 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIAP1O43715 76 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PEMTQ9UBM1 199 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf72Q8NBR9 251 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ATXN8Q156A1 80 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC01620Q4KN68 170 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3-53P01767 116 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 MIAQ16674 131 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SPANXDQ9BXN6 97 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SPANXCQ9NY87 97 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DAND5Q8N907 189 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 XCL2Q9UBD3 114 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 INSP01308 110 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ICOSQ9Y6W8 199 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB114Q30KQ6 69 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 C4orf3Q8WVX3 66 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP1-202ENST00000417536 LY6G6DO95868 133 aa13.46□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFAND6Q6FIF0 208 aa13.46□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC30Q96LL9 226 aa13.46□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 M0QXV9 152 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 RS1O15537 224 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 BEAN1Q3B7T3 259 aa13.45□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM262E9PQX1 116 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8N2B8 174 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 COX6A2Q02221 97 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM101Q96IK0 257 aa13.43□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 INAFM1C9JVW0 142 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC2BQ92478 149 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ODF3L2Q3SX64 289 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0U1RRA0 63 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFA7O95182 113 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 COX6CP09669 75 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
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SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00694P0DN24 101 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TIRAPP58753 221 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 C2orf82Q6UX34 121 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-202ENST00000417536 STHQ8IWL8 128 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 BAHCC1Q9P281 2608 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFA1O15239 70 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf158Q8N1D5 194 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 H7C423 109 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa13.38□□□□□ -0.27
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SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00242Q5T6M2 205 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2WQ96B02 151 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 TIMM17BO60830 172 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 IFITM1P13164 125 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 HERVK_113P63121 156 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZTI0 123 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM86BQ8N661 226 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 TEX29Q8N6K0 151 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF183Q96D59 192 aa13.34□□□□□ -0.27
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