RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.87□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.87□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.87□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.87□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.87□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ESM1Q9NQ30 184 aa3.87□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPANXCQ9NY87 97 aa3.87□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa3.87□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CSMD2Q7Z408 3487 aa3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ITPR3Q14573 2671 aa3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 G3V4G9 280 aa3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPRY2O43597 315 aa3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CD28P10747 220 aa3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GYPEP15421 78 aa3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PROK1P58294 105 aa3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HERVK_113P63121 156 aa3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NDUFA11Q86Y39 141 aa3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM104AQ969W3 186 aa3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa3.86□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SMIM9A6NGZ8 99 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 K7EQD1 137 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SAP30O75446 220 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AZU1P20160 251 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZFAND6Q6FIF0 208 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SFTA2Q6UW10 78 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RAB37Q96AX2 223 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 YAE1D1Q9NRH1 226 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.85□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa3.84□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 H3BMG7 143 aa3.84□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CFC1BP0CG36 223 aa3.84□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CFC1P0CG37 223 aa3.84□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.84□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HERV-K104P63124 156 aa3.84□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.84□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.84□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa3.84□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 XCL2Q9UBD3 114 aa3.84□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SORL1Q92673 2214 aa3.84□□□□□ -1.79
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.84□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 A0A0J9YXV3 536 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLAC8L1A1L4L8 177 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 K7ERJ3 54 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NDUFA1O15239 70 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TSPAN13O95857 204 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINC00694P0DN24 101 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HTN1P15515 57 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TCTAP57738 103 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LITAFQ99732 161 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRO0461Q9UI25 63 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC168Q8NDH2 2452 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TLN2Q9Y4G6 2542 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PDZD2O15018 2839 aa3.83□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHD6Q8TD26 2715 aa3.82□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.82□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGHV3-33P01772 117 aa3.82□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SCGB1A1P11684 91 aa3.82□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MIAQ16674 131 aa3.82□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.82□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM101Q96IK0 257 aa3.82□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ERG28Q9UKR5 140 aa3.82□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa3.81□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 A0A1B0GUV1 79 aa3.81□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 A4D1N5 150 aa3.81□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LYRM9A8MSI8 78 aa3.81□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 B5MCH6 92 aa3.81□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COX6CP09669 75 aa3.81□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.81□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.81□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q6ZUT4 128 aa3.81□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VPS25Q9BRG1 176 aa3.81□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM243Q9BU79 118 aa3.81□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SELENOKQ9Y6D0 94 aa3.81□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HIVEP2P31629 2446 aa3.81□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SONP18583 2426 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms