RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 UBE2D2P62837 147 aa4.23□□□□□ -1.73
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PTPRZ1-201ENST00000393386 UBE2D3P61077 147 aa4.22□□□□□ -1.73
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PTPRZ1-201ENST00000393386 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRZ1-201ENST00000393386 C15orf65H3BRN8 121 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRZ1-201ENST00000393386 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.22□□□□□ -1.73
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PTPRZ1-201ENST00000393386 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.22□□□□□ -1.73
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PTPRZ1-201ENST00000393386 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRZ1-201ENST00000393386 PKD1L2Q7Z442 2459 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRZ1-201ENST00000393386 CDIP1Q9H305 208 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRZ1-201ENST00000393386 PROK2Q9HC23 129 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
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PTPRZ1-201ENST00000393386 H3BUA1 57 aa4.19□□□□□ -1.74
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PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
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PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF883P0CG24 379 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRZ1-201ENST00000393386 Q8N3U1 123 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRZ1-201ENST00000393386 LYPD2Q6UXB3 125 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRZ1-201ENST00000393386 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRZ1-201ENST00000393386 COL8A2P25067 703 aa4.18□□□□□ -1.74
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PTPRZ1-201ENST00000393386 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRZ1-201ENST00000393386 C11orf1Q9H5F2 150 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRZ1-201ENST00000393386 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.16□□□□□ -1.74
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PTPRZ1-201ENST00000393386 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRZ1-201ENST00000393386 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRZ1-201ENST00000393386 TLN2Q9Y4G6 2542 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRZ1-201ENST00000393386 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRZ1-201ENST00000393386 ATMQ13315 3056 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRZ1-201ENST00000393386 BCE1O60756 84 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRZ1-201ENST00000393386 UBE2D1P51668 147 aa4.16□□□□□ -1.74
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