RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 MIAQ16674 131 aa7.67□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 Q6ZS46 218 aa7.67□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 CEP350Q5VT06 3117 aa7.67□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 PTPRSQ13332 1948 aa7.67□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 A0A0B4J2C4 111 aa7.67□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.67□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 B9D2Q9BPU9 175 aa7.67□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 A0A1B0GX51 115 aa7.66□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 IGLV1-40P01703 118 aa7.66□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 WFDC2Q14508 124 aa7.66□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 NFE4Q86UQ8 179 aa7.66□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 CLEC2BQ92478 149 aa7.66□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.66□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 A0A0J9YXY3 114 aa7.66□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 AVPP01185 164 aa7.66□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 ACANP16112 2415 aa7.66□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.66□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.66□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.66□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 PDE6GP18545 87 aa7.66□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 MP68P56378 58 aa7.65□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 KRTAP10-9P60411 292 aa7.65□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
ZNF548-202ENST00000366197 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.65□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.64□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.64□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.63□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 TAX1BP3O14907 124 aa7.63□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 PROK1P58294 105 aa7.63□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 RBX1P62877 108 aa7.63□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 A0A087WZ39 114 aa7.63□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.63□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 SYCNQ0VAF6 134 aa7.63□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.62□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 KLLNB2CW77 178 aa7.62□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.62□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.62□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 IGLV2-11P01706 119 aa7.62□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.62□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 DCANP1Q8TF63 244 aa7.61□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 SMR3AQ99954 134 aa7.61□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 A0A096LNI7 61 aa7.61□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 RNF185Q96GF1 192 aa7.61□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.61□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 H0Y9J4 135 aa7.6□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 FOXI1Q12951 378 aa7.6□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.6□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM258P61165 79 aa7.6□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 ATOX1O00244 68 aa7.6□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 NDUFA7O95182 113 aa7.6□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM223A0PJW6 202 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 A0A1W2PPR1 153 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 PRR9Q5T870 116 aa7.59□□□□□ -1.19
ZNF548-202ENST00000366197 LELP1Q5T871 98 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.59□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 PTH2Q96A98 100 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 U3KQK5 164 aa7.58□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 LRP4O75096 1905 aa7.57□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 PRM2P04554 102 aa7.57□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.57□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.57□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 C9orf85Q96MD7 179 aa7.57□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 BPY2O14599 106 aa7.57□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 TCL1BO95988 128 aa7.57□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 B5MCH6 92 aa7.56□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 TSHBP01222 138 aa7.56□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.56□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 NRACQ8N912 160 aa7.56□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 C6orf99Q4VX62 202 aa7.56□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 C7orf33Q8WU49 177 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.55□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 M0R2N4 97 aa7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 LINC00643Q86TS7 51 aa7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 IGLV1-51P01701 117 aa7.54□□□□□ -1.2
ZNF548-202ENST00000366197 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms