RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356713.4

CNNM1-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM1, Length 5,959 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1-201ENST00000356713 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.91□□□□□ -0.02
CNNM1-201ENST00000356713 ZNF843Q8N446 348 aa14.91□□□□□ -0.02
CNNM1-201ENST00000356713 DENND4AQ7Z401 1863 aa14.91□□□□□ -0.02
CNNM1-201ENST00000356713 TMEM131Q92545 1883 aa14.9□□□□□ -0.02
CNNM1-201ENST00000356713 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.89□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 CRIP1P50238 77 aa14.89□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.88□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 A0A0U1RQV1 116 aa14.88□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 PRM2P04554 102 aa14.88□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 PRR15LQ9BU68 103 aa14.88□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 RBX1P62877 108 aa14.88□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 Q6ZPA2 131 aa14.88□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 ZNF702PQ9H963 129 aa14.88□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.87□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 RNF185Q96GF1 192 aa14.87□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 SNURFQ9Y675 71 aa14.86□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 PRR4Q16378 134 aa14.85□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa14.85□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.85□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 MED13LQ71F56 2210 aa14.85□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa14.85□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 UQCRQO14949 82 aa14.84□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.84□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa14.84□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 Q6ZQY7 126 aa14.84□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 M0R378 163 aa14.83□□□□□ -0.03
CNNM1-201ENST00000356713 DSCAML1Q8TD84 2053 aa14.83□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 CD164L2Q6UWJ8 174 aa14.83□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 TNCP24821 2201 aa14.83□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 MBD6Q96DN6 1003 aa14.83□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa14.82□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.82□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.82□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 TSHBP01222 138 aa14.82□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa14.82□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.82□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 LINC01006Q8NI28 216 aa14.82□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa14.81□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 RETNQ9HD89 108 aa14.81□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa14.81□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa14.81□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.81□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 COL4A3Q01955 1670 aa14.8□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 UBE2D2P62837 147 aa14.8□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 FAM30AQ9NZY2 134 aa14.8□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 EBI3Q14213 229 aa14.8□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 LELP1Q5T871 98 aa14.79□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 SERP1Q9Y6X1 66 aa14.79□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 PRR9Q5T870 116 aa14.79□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 Q6ZS46 218 aa14.78□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 U3KQK5 164 aa14.78□□□□□ -0.04
CNNM1-201ENST00000356713 SMIM11BQ8TCY0 68 aa14.77□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 Q8N9L7 120 aa14.75□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa14.75□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.75□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa14.75□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 CREBBPQ92793 2442 aa14.75□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.74□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 A6NED7 52 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 IGLV2-11P01706 119 aa14.73□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 NRACQ8N912 160 aa14.72□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 FSTL3O95633 263 aa14.72□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.71□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CNNM1-201ENST00000356713 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 SMR3AQ99954 134 aa14.7□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 TIMM17BO60830 172 aa14.69□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 V9GYY9 64 aa14.69□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 C10orf25Q5T742 122 aa14.68□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 RETNLBQ9BQ08 111 aa14.68□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 Q6ZVQ6 151 aa14.67□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa14.67□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 LINC00474Q9P2X8 69 aa14.67□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.67□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 EDN2P20800 178 aa14.67□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 GAS8-AS1O95177 125 aa14.67□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.66□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 M0QXV9 152 aa14.66□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.66□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 Q8N6K4 173 aa14.66□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 CELA1Q9UNI1 258 aa14.65□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 HIVEP2P31629 2446 aa14.65□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 KLLNB2CW77 178 aa14.65□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 COX17Q14061 63 aa14.65□□□□□ -0.06
CNNM1-201ENST00000356713 SERP2Q8N6R1 65 aa14.64□□□□□ -0.07
CNNM1-201ENST00000356713 LST1O00453 97 aa14.64□□□□□ -0.07
CNNM1-201ENST00000356713 NUPR2A6NF83 97 aa14.64□□□□□ -0.07
CNNM1-201ENST00000356713 IGLV1-40P01703 118 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms