RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZUT4 128 aa18.94■□□□□ 0.62
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HOXD8-201ENST00000313173 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa18.93■□□□□ 0.62
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HOXD8-201ENST00000313173 HERVK_113P63121 156 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00242Q5T6M2 205 aa18.72■□□□□ 0.59
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HOXD8-201ENST00000313173 A0A096LPF7 62 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 K7ERU9 68 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM13P0DJ93 91 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 RNF151Q2KHN1 245 aa18.64■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 NOTCH1P46531 2555 aa18.63■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 HTN3P15516 51 aa18.62■□□□□ 0.57
HOXD8-201ENST00000313173 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
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