RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PFN2P35080 140 aa6.4□□□□□ -1.38
HERC3-201ENST00000264345 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 DAD1P61803 113 aa6.4□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 GYPEP15421 78 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 ZNF843Q8N446 348 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 XGP55808 180 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 C16orf95Q9H693 158 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 H3BQ85 93 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZSN1 163 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 ATP5G1P05496 136 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 LINC00643Q86TS7 51 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 REV3LO60673 3130 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 DPH3Q96FX2 82 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 A8MZ25 164 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 C5orf38Q86SI9 138 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 J3QKU1 62 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 PRO0255Q9UI72 69 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 CDIP1Q9H305 208 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 LYRM9A8MSI8 78 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 XCL1P47992 114 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 MRAPQ8TCY5 172 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 IMUPQ9GZP8 106 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 NACAE9PAV3 2078 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 NDUFA7O95182 113 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 HAMPP81172 84 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 TMEM126AQ9H061 195 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 PRM2P04554 102 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 CRLF1O75462 422 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 COX6A2Q02221 97 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 LINC01006Q8NI28 216 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 A0A096LNT2 108 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 F5H768 121 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 IGLV1-51P01701 117 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC3-201ENST00000264345 FHL3Q13643 280 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 SZT2Q5T011 3432 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 LITAFQ99732 161 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 LINC00694P0DN24 101 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 MUC7Q8TAX7 377 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GX51 115 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 ATOX1O00244 68 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 HILS1P60008 231 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP10-9P60411 292 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 AGRNO00468 2067 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 IGF2RP11717 2491 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 UBL5Q9BZL1 73 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 LECT2O14960 151 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 NOTCH2Q04721 2471 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 A0A087WZ39 114 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 COX17Q14061 63 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 Q8IZM0 81 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 CACNA1AO00555 2505 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 FHL2Q14192 279 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 IL17DQ8TAD2 202 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 A0A096LPF7 62 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC3-201ENST00000264345 PTPN13Q12923 2485 aa6.29□□□□□ -1.4
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