RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 TMEM89A2RUT3 159 aa6.25□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 M0R2P5 195 aa6.25□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.25□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.25□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 CIDEAO60543 219 aa6.25□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.25□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 CLEC2BQ92478 149 aa6.25□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.25□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.25□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.25□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 A0A096LPF7 62 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 GAGE7O76087 117 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 MT-ATP8P03928 68 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 GAGE12FP0CL80 117 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 GAGE12GP0CL81 117 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 GAGE12IP0CL82 117 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 DSCR9P59020 149 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 STHQ8IWL8 128 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 LEPROTO15243 131 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 FSHBP01225 129 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 FOXI1Q12951 378 aa6.23□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 CCL24O00175 119 aa6.23□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 SIGMAR1Q99720 223 aa6.23□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 DEFB4AO15263 64 aa6.23□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-33P01772 117 aa6.23□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 UBE2D3P61077 147 aa6.23□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 UBE2D2P62837 147 aa6.23□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 ZNF415Q09FC8 603 aa6.23□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 RHOHQ15669 191 aa6.23□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 J3QLI3 93 aa6.22□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.22□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.22□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.22□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 TRIAP1O43715 76 aa6.22□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 INSP01308 110 aa6.22□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.22□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 LITAFQ99732 161 aa6.22□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 PEMTQ9UBM1 199 aa6.22□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 ERG28Q9UKR5 140 aa6.22□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GV72 72 aa6.21□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 XGP55808 180 aa6.21□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.21□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 ODF3Q96PU9 254 aa6.21□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.21□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.21□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 CDIP1Q9H305 208 aa6.21□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.21□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.2□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 A8MWV9 139 aa6.2□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 DEFB130BP0DP73 79 aa6.2□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 DEFB130AP0DP74 79 aa6.2□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 TMEM101Q96IK0 257 aa6.2□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 Q9H8V8 135 aa6.2□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A20O43772 301 aa6.2□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.2□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.2□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 GAGE6Q13070 117 aa6.2□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.2□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 CRLF1O75462 422 aa6.19□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 Q8N2B8 174 aa6.19□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 LINC01006Q8NI28 216 aa6.19□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 NOTCH1P46531 2555 aa6.19□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.18□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 RNF152Q8N8N0 203 aa6.18□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 STAB1Q9NY15 2570 aa6.18□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.18□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 Q8N3U1 123 aa6.18□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 J3QR89 54 aa6.17□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.17□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 TEN1Q86WV5 123 aa6.17□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.16□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 RS1O15537 224 aa6.16□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.16□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 MAST4O15021 2626 aa6.16□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 C5orf38Q86SI9 138 aa6.16□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.16□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 SPATA25Q9BR10 227 aa6.16□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.16□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.15□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 LINC01620Q4KN68 170 aa6.15□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.15□□□□□ -1.42
GINS1-201ENST00000262460 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.15□□□□□ -1.43
GINS1-201ENST00000262460 K7EQD1 137 aa6.15□□□□□ -1.43
GINS1-201ENST00000262460 PFN2P35080 140 aa6.14□□□□□ -1.43
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP10-3P60369 221 aa6.14□□□□□ -1.43
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.14□□□□□ -1.43
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