RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 UBE2AP49459 152 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 PRORYQ9H606 182 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 TMEM89A2RUT3 159 aa11.93□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 GRNP28799 593 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZQY7 126 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 CCL18P55774 89 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 C3orf84H3BNL1 204 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZTI0 123 aa11.92□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 PRO0255Q9UI72 69 aa11.91□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.91□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa11.9□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.9□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.9□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 ODF3BA8MYP8 253 aa11.9□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 PROK1P58294 105 aa11.9□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.9□□□□□ -0.5
CTIF-201ENST00000256413 EBI3Q14213 229 aa11.9□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 MAP6D1Q9H9H5 199 aa11.9□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 PRR9Q5T870 116 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 PRR15LQ9BU68 103 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 K7EQG2 157 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 LINC01548A6NM66 108 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 REG3AQ06141 175 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZSV7 163 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 TANC2Q9HCD6 1990 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 PRYO14603 147 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 DCANP1Q8TF63 244 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 RPS28P62857 69 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 CRYGDP07320 174 aa11.84□□□□□ -0.51
CTIF-201ENST00000256413 A6NDX4 124 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 CRYGAP11844 174 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 WFDC13Q8IUB5 93 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 C9orf85Q96MD7 179 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.83□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 TMEM131Q92545 1883 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 LY6LH3BQJ8 138 aa11.82□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 HCFC1P51610 2035 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 CELA1Q9UNI1 258 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 KLLNB2CW77 178 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 PRO0461Q9UI25 63 aa11.81□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa11.8□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 A0A0J9YWU9 116 aa11.8□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 PSPHP1O15172 72 aa11.8□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 C4orf26Q17RF5 130 aa11.8□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 Q8N3U1 123 aa11.8□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 HIGD2AQ9BW72 106 aa11.8□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 A0A087WYN8 130 aa11.8□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa11.8□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 CASC2Q6XLA1 102 aa11.79□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.79□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa11.79□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 DEFB4AO15263 64 aa11.78□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.78□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 ZNF843Q8N446 348 aa11.78□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 Q8N814 137 aa11.78□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.78□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 K7ERS5 55 aa11.78□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 LINC00846Q9NV44 126 aa11.78□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.77□□□□□ -0.52
CTIF-201ENST00000256413 WISP2O76076 250 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 Q8N9L7 120 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 B9D2Q9BPU9 175 aa11.77□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 DEFB135Q30KP9 77 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.76□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 TMEM254Q8TBM7 123 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 F8W735 103 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa11.75□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 COX17Q14061 63 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 SMIM1B2RUZ4 78 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 PLA2G2AP14555 144 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa11.74□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 HILS1P60008 231 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 ESRGQ1W209 222 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 ZNF580Q9UK33 172 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.73□□□□□ -0.53
CTIF-201ENST00000256413 M0R378 163 aa11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms