RNA–Protein interactions for RNA: YMR188C

MRPS17, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS17, Length 714 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS17	YMR188C	SPC72	P39723	622 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS17	YMR188C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MRPS17	YMR188C	RFX1	P48743	811 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS17	YMR188C	TIM50	Q02776	476 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS17	YMR188C	RIM13	Q03792	727 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS17	YMR188C	YFT2	Q06676	274 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MRPS17	YMR188C	NUC1	P08466	329 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	PCK1	P10963	549 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	CDS1	P38221	457 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	TMN3	P40071	706 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	SMK1	P41808	388 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	ACS1	Q01574	713 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	TRI1	Q05024	226 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	PSY4	P38193	441 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	PSF2	P40359	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	YGR151C	P53287	111 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	SSP2	Q08646	371 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	OSW1	Q08692	278 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	CLB4	P24871	460 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	NTH1	P32356	751 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	YLF2	P38746	405 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	PUG1	P40100	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	YDL183C	P48569	320 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	FDC1	Q03034	503 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	ARA2	Q04212	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	CIA1	Q05583	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	CTT1	P06115	562 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	PTP1	P25044	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	SET3	P36124	751 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	STB5	P38699	743 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	VFA1	P40080	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	GSM1	P42950	618 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	MPS3	P47069	682 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	SPC98	P53540	846 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	CRD1	Q07560	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	AAD4	Q07747	329 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	SIR1	P21691	654 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	RIT1	P23796	513 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	MRPL36	P36531	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	ERP2	P39704	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	SLC1	P33333	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	APL3	P38065	1025 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	YMC2	P38087	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	YJL193W	P39542	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	RAD26	P40352	1085 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	CAB2	P40506	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
MRPS17	YMR188C	VPS33	P20795	691 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	RER1	P25560	188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	YCL049C	P25577	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	RAD16	P31244	790 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	MCM10	P32354	571 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	XRS2	P33301	854 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	ELF1	P36053	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	CTP1	P38152	299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	UME6	P39001	836 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	KHA1	P40309	873 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	NET1	P47035	1189 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	VPS64	Q03944	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	ENT2	Q05785	613 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS17	YMR188C	CHS3	P29465	1165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS17	YMR188C	DSS4	P32601	143 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS17	YMR188C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS17	YMR188C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS17	YMR188C	YBR138C	P38277	524 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS17	YMR188C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS17	YMR188C	LRO1	P40345	661 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS17	YMR188C	POL31	P46957	487 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS17	YMR188C	ATG21	Q02887	496 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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