RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	COY1	P34237	679 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ETR1	P38071	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	AGP2	P38090	596 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	STN1	P38960	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	MND2	P40577	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ASG7	P46993	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	RPA14	P50106	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ORM1	P53224	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ASI1	P54074	624 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SLT2	Q00772	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	HFD1	Q04458	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	TPO1	Q07824	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	IZH4	Q99393	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	MET4	P32389	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	APN2	P38207	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	PFD1	P46988	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	RFX1	P48743	811 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	TEL2	P53038	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ADI1	Q03677	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	THI20	Q08224	551 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	VPS3	P23643	1011 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	CDC20	P26309	610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SIN4	P32259	974 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	TOA1	P32773	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	DUR3	P33413	735 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SRL3	P36167	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	HSL7	P38274	827 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YBP1	P38315	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	AVT2	P39981	480 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	TAH11	P47112	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YJR107W	P47145	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	PEX31	P53203	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YPR003C	P53394	754 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	UBX4	P54730	416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	MUK1	Q02866	612 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	PLP1	Q04004	230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SND1	Q04007	877 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YET3	Q07451	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YPT6	Q99260	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	GPA2	P10823	449 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SPS22	P25380	463 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	AAD3	P25612	363 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	CSE1	P33307	960 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	DRE2	P36152	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	UBX7	P38349	436 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	IML2	P47031	731 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	ALT2	P52892	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	BIO4	P53630	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SKY1	Q03656	742 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	NSE1	Q07913	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
KAR2	YJL034W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	SPE4	Q12455	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KAR2	YJL034W	AMS1	P22855	1083 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	GAC1	P28006	793 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	URA10	P30402	227 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	SLA2	P33338	968 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	PEX5	P35056	612 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	AIM18	P38884	321 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	RRT5	P43607	289 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	COS6	P53344	381 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	NMA111	P53920	997 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	VPS9	P54787	451 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	SLG1	P54867	378 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	MGR3	Q04472	501 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	GTB1	Q04924	702 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	HOS1	Q12214	470 aa		4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.64	not detected
KAR2	YJL034W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	SEM1	O94742	89 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	GAL80	P04387	435 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	HEM3	P28789	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	BRF1	P29056	596 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	RFC3	P38629	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KAR2	YJL034W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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