RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD6Q6ZSS7 791 aa29.45■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX11Q8IYF3 940 aa29.45■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXL16Q8N461 479 aa29.45■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa29.45■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CNNM2Q9H8M5 875 aa29.45■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR19Q8NEZ3 1342 aa29.45■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 NAV1Q8NEY1 1877 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 FOCADQ5VW36 1801 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD17O75943 681 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC15Q96MV8 337 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 INCENPQ9NQS7 918 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 TPCN1Q9ULQ1 816 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMD14O00487 310 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 DDIT3P35638 169 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC2Q9BYS8 371 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXD4L1Q9NU39 408 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 ANTXR2P58335 489 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CHST3Q7LGC8 479 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 NKX2-3Q8TAU0 364 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 JDP2Q8WYK2 163 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT23Q9C075 422 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 MCM9Q9NXL9 1143 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINA10Q9UK55 444 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 B4E1Z4 1266 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM22K7EJ46 135 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 PRC1O43663 620 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 LARGE1O95461 756 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L8P0C7I0 530 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 GMLQ99445 158 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 FGRP09769 529 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 RASSF7Q02833 373 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 ME3Q16798 604 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CYB5R4Q7L1T6 521 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 FLT1P17948 1338 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 PCP11498 1178 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 FGD1P98174 961 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 C12orf60Q5U649 245 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 BRF1Q92994 677 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 SYT17Q9BSW7 474 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP2D6P10635 497 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCL9Q07325 125 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 USP40Q9NVE5 1235 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-215ENST00000628018 ECM29Q5VYK3 1845 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 PRELPP51888 382 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 EVX2Q03828 476 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 STK11IPQ8N1F8 1099 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSWIM5Q9P217 1185 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM4AO75164 1064 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 AMOTL1Q8IY63 956 aa29.36■■■□□ 2.29
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CAPNS1-215ENST00000628018 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ROBO3Q96MS0 1386 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 EVCP57679 992 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CIAPIN1Q6FI81 312 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 MYH1P12882 1939 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.292e-8■■■□□ 16.5
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CAPNS1-215ENST00000628018 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM87BQ96K49 555 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 TOMM22Q9NS69 142 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ORC4O43929 436 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 APOBRQ0VD83 1088 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP100Q494V2 611 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ESR2Q92731 530 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CHMP5Q9NZZ3 219 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 TNIP1Q15025 636 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 MTA3Q9BTC8 594 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 HDAC9Q9UKV0 1011 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-215ENST00000628018 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 PLCD1P51178 756 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 PDE4BQ07343 736 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC83Q8IWF9 413 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 NECAB1Q8N987 351 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 FZD9O00144 591 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 PICALMQ13492 652 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa29.3■■■□□ 2.28
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