RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.46■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ZBTB43O43298 467 aa15.46■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SUSD4Q5VX71 490 aa15.46■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 AIDAQ96BJ3 306 aa15.46■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa15.46■□□□□ 0.07
C9orf170-201ENST00000623052 MROH5Q6ZUA9 1318 aa15.46■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM67Q5HYA8 995 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 LCORLQ8N3X6 602 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 DPF2Q92785 391 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SYCP1Q15431 976 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 TMC6Q7Z403 805 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 TIGD1Q96MW7 591 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SMC2O95347 1197 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 BMP6P22004 513 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SYKP43405 635 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 GRIN1Q05586 938 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF592Q92610 1267 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 IMPACTQ9P2X3 320 aa15.45■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SMIM22K7EJ46 135 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 FOXN1O15353 648 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 CDKL5O76039 1030 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SHISA4Q96DD7 197 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 STK36Q9NRP7 1315 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 TAF1P21675 1872 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 LIFRP42702 1097 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 CBX1P83916 185 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 LONRF3Q496Y0 759 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC112Q8NEF3 446 aa15.44■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 GSDMDP57764 484 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 ADGRA1Q86SQ6 560 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 PRDM4Q9UKN5 801 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 MYH6P13533 1939 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 NFXL1Q6ZNB6 911 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 CACNA1SQ13698 1873 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 IKBKBO14920 756 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 BCAMP50895 628 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 FANCCQ00597 558 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 PDE4BQ07343 736 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 PTPN14Q15678 1187 aa15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 PTPN21Q16825 1174 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SPECC1Q5M775 1068 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 NAPBQ9H115 298 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 KCNJ14Q9UNX9 436 aa15.42■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 BTBD18B2RXH4 712 aa15.41■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SLC5A1P13866 664 aa15.41■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 STAG1Q8WVM7 1258 aa15.41■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 INTS13Q9NVM9 706 aa15.41■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.41■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SCN7AQ01118 1682 aa15.41■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 MMP1P03956 469 aa15.41■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 IFNAR1P17181 557 aa15.41■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 KRBA2Q6ZNG9 492 aa15.41■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 NOSTRINQ8IVI9 506 aa15.41■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 DLEC1Q9Y238 1755 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM232C9JQI7 657 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 FANCGO15287 622 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC150Q8NCX0 1101 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 V9GYY5 206 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 CUTAO60888 179 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA8FQ08AF8 430 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 MAP3K12Q12852 859 aa15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms