RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622298.1

5S_rRNA.13-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 123 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CD97P48960 835 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 FGD1P98174 961 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ZAR1Q86SH2 424 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 NPAS4Q8IUM7 802 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 GPBAR1Q8TDU6 330 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ACSBG1Q96GR2 724 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ATXN3LQ9H3M9 355 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SEMA6CQ9H3T2 930 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 LEMD3Q9Y2U8 911 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 AK5Q9Y6K8 562 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa3.35□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 FAM170BA6NMN3 283 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 GP2P55259 537 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TTLL4Q14679 1199 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 LRRC14Q15048 493 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CCDC27Q2M243 656 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 RASIP1Q5U651 963 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 LLGL2Q6P1M3 1020 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ANKRD24Q8TF21 1146 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 DISC1Q9NRI5 854 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PIM2Q9P1W9 311 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PARP2Q9UGN5 583 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CSADQ9Y600 493 aa3.34□□□□□ -1.87
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TRIM37O94972 964 aa3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 DAB2P98082 770 aa3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PSMD2Q13200 908 aa3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 DUSP27Q5VZP5 1158 aa3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PCNX4Q63HM2 1172 aa3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 C12orf40Q86WS4 652 aa3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 GATA6Q92908 595 aa3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 C1GALT1Q9NS00 363 aa3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PCDHA4Q9UN74 947 aa3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CYP8B1Q9UNU6 501 aa3.33□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 DCDC2CA8MYV0 355 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CYP26A1O43174 497 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 NEFMP07197 916 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 FOSL1P15407 271 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SPINK2P20155 84 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 LMNB1P20700 586 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ERVK-24P63145 666 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CYP27A1Q02318 531 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CDK5R2Q13319 367 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 MAP3K11Q16584 847 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PPM1JQ5JR12 505 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TTBK2Q6IQ55 1244 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SV2BQ7L1I2 683 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ZNF765Q7L2R6 523 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 FBXO33Q7Z6M2 555 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 RNF214Q8ND24 703 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ELMO3Q96BJ8 720 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 FAM161BQ96MY7 647 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PICK1Q9NRD5 415 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa3.32□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 SORBS3O60504 671 aa3.31□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 FAM87AP0C7U9 286 aa3.31□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ERCC3P19447 782 aa3.31□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 CYP27C1Q4G0S4 372 aa3.31□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 MEI1Q5TIA1 1274 aa3.31□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 OGFOD3Q6PK18 319 aa3.31□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TMC4Q7Z404 712 aa3.31□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 DTX1Q86Y01 620 aa3.31□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ISL2Q96A47 359 aa3.31□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ZBTB7CA1YPR0 619 aa3.3□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa3.3□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 ADAMTS4O75173 837 aa3.3□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 WNT11O96014 354 aa3.3□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 C8AP07357 584 aa3.3□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 RING1Q06587 406 aa3.3□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 INPP5AQ14642 412 aa3.3□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
5S_rRNA.13-201ENST00000622298 MSMPQ1L6U9 139 aa3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.1 ms