RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619831.4

DMD-229, Transcript of dystrophin, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene DMD, Length 13,734 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMD-229	ENST00000619831	RASEF	Q8IZ41	740 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831		A0A087WZG4	1122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831		A0A1B0GUA9	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	GRIN2B	Q13224	1484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CEP104	O60308	925 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	SLCO1A2	P46721	670 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	BRD1	O95696	1058 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ATP11A	P98196	1134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	TMED1	Q13445	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ZBTB43	O43298	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	RBL2	Q08999	1139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	MYH8	P13535	1937 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CDC25C	P30307	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831		A0A0D9SFI3	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	OPHN1	O60890	802 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	APBA1	Q02410	837 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PDCL	Q13371	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PIK3C2G	O75747	1445 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	IQGAP2	Q13576	1575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	TACC1	O75410	805 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	DCTPP1	Q9H773	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	MYO1F	O00160	1098 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PFKFB1	P16118	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	MYO1C	O00159	1063 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	LGR5	O75473	907 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ANAPC15	P60006	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	SNX1	Q13596	522 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	SYNM	O15061	1565 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	KRT9	P35527	623 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PSMC4	P43686	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CHRNA2	Q15822	529 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	UST	Q9Y2C2	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ELP1	O95163	1332 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	KIF3C	O14782	793 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	SMIM24	O75264	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	PICALM	Q13492	652 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	RTN1	Q16799	776 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	DDX12P	Q92771	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	TRIM4	Q9C037	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	MOCS3	O95396	460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	YY1	P25490	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DMD-229	ENST00000619831	WTAP	Q15007	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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