RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619151.4

BRF1-221, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 5 BASIC

Gene BRF1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-221	ENST00000619151	YDJC	A8MPS7	323 aa		32.79	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		32.79	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	NEDD4	P46934	1319 aa		32.78	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	TMEM87B	Q96K49	555 aa		32.78	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	BTD	P43251	543 aa		32.77	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	USP5	P45974	858 aa		32.77	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		32.77	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	CHST3	Q7LGC8	479 aa		32.77	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	GTF3C6	Q969F1	213 aa		32.77	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151		B4E1Z4	1266 aa		32.77	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	FZD9	O00144	591 aa		32.77	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	ANTXR2	P58335	489 aa		32.77	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	NBR1	Q14596	966 aa		32.77	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	SBK1	Q52WX2	424 aa		32.77	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		32.77	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	NECAB1	Q8N987	351 aa		32.77	■■■□□ 2.84
BRF1-221	ENST00000619151	LAMB1	P07942	1786 aa		32.76	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	CTR9	Q6PD62	1173 aa		32.76	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	GBP4	Q96PP9	640 aa		32.76	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	MTA3	Q9BTC8	594 aa		32.76	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	PFKFB2	O60825	505 aa		32.75	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	EVC	P57679	992 aa		32.75	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	APOBR	Q0VD83	1088 aa		32.75	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		32.75	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	SCN9A	Q15858	1988 aa		32.74	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	ST3GAL1	Q11201	340 aa		32.74	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	STK3	Q13188	491 aa		32.74	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		32.74	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	TOMM22	Q9NS69	142 aa		32.74	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	RNF181	Q9P0P0	153 aa		32.74	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	USP17L12	C9JPN9	530 aa		32.73	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	USP17L21	D6R901	530 aa		32.73	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	CERS5	Q8N5B7	392 aa		32.73	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	USP17L3	A6NCW0	530 aa		32.72	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	USP17L4	A6NCW7	530 aa		32.72	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	NT5C2	P49902	561 aa		32.72	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		32.72	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		32.72	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	ESR2	Q92731	530 aa		32.72	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	UTRN	P46939	3433 aa		32.72	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	KDM4A	O75164	1064 aa		32.72	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	GJB2	P29033	226 aa		32.72	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		32.72	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		32.71	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	CXCL9	Q07325	125 aa		32.71	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	TEX11	Q8IYF3	940 aa		32.71	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		32.71	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	DACT2	Q5SW24	774 aa		32.7	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
BRF1-221	ENST00000619151	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	PSME4	Q14997	1843 aa		32.69	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	FGR	P09769	529 aa		32.69	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		32.69	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	TEKT1	Q969V4	418 aa		32.69	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		32.69	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		32.68	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	ERICH2	A1L162	156 aa		32.68	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151		F8W031	263 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	RAD17	O75943	681 aa		32.68	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	BRD1	O95696	1058 aa		32.68	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	PDC	P20941	246 aa		32.68	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	SCRN1	Q12765	414 aa		32.68	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		32.68	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		32.68	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	MRI	Q9BWK5	157 aa		32.68	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	LIFR	P42702	1097 aa		32.67	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	PDE4B	Q07343	736 aa		32.67	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	TNIP1	Q15025	636 aa		32.67	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		32.67	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		32.67	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	PSMD14	O00487	310 aa		32.67	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	PKP1	Q13835	747 aa		32.67	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		32.67	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	INCENP	Q9NQS7	918 aa		32.67	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		32.66	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		32.66	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	ORC4	O43929	436 aa		32.66	■■■□□ 2.82
BRF1-221	ENST00000619151	RHBDL3	P58872	404 aa		32.66	■■■□□ 2.82

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