RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598904.5

RINL-208, Transcript of Ras and Rab interactor like, human

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene RINL, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RINL-208	ENST00000598904	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	28.91	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	CXCL9	Q07325	125 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	RASSF7	Q02833	373 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	OGFOD1	Q8N543	542 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	USP40	Q9NVE5	1235 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904		Q6ZUG5	572 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	GML	Q99445	158 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		28.89	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	FBXL16	Q8N461	479 aa		28.89	■■■□□ 2.22
RINL-208	ENST00000598904	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	LAMA4	Q16363	1823 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	PRC1	O43663	620 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	MMP14	P50281	582 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	C12orf60	Q5U649	245 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	TOMM22	Q9NS69	142 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	FLT1	P17948	1338 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	PSME4	Q14997	1843 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	USP17L8	P0C7I0	530 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	NEDD4	P46934	1319 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904		B4E1Z4	1266 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	FGR	P09769	529 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	CUL4A	Q13619	759 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	CFAP100	Q494V2	611 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	FZD9	O00144	591 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	NT5C2	P49902	561 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	PDE4B	Q07343	736 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	CHST3	Q7LGC8	479 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	LMNB1	P20700	586 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	ESR2	Q92731	530 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	BRF1	Q92994	677 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	INCENP	Q9NQS7	918 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	TMEM87B	Q96K49	555 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	KDM4A	O75164	1064 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	PRELP	P51888	382 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	MTA3	Q9BTC8	594 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RINL-208	ENST00000598904	CYP2D6	P10635	497 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	ANTXR2	P58335	489 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	ORC4	O43929	436 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	PICALM	Q13492	652 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	DLGAP5	Q15398	846 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	ME3	Q16798	604 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	TTC6	Q86TZ1	520 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	IDI2	Q9BXS1	227 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	28.8	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	SMIM22	K7EJ46	135 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	SPDYE6	P0CI01	402 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	ERICH2	A1L162	156 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	PLCD1	P51178	756 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	EVC	P57679	992 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	DPF2	Q92785	391 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
RINL-208	ENST00000598904	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		28.77	■■■□□ 2.2

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