RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590104.1

LAMA3-211, Transcript of laminin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 5

Gene LAMA3, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3-211ENST00000590104 SNX27Q96L92 541 aa8.45□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 NLRP3Q96P20 1036 aa8.45□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 PSMD1Q99460 953 aa8.45□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 BBOX1O75936 387 aa8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 GSK3AP49840 483 aa8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 RELBQ01201 579 aa8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 PTK2Q05397 1052 aa8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 NR6A1Q15406 480 aa8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 HLFQ16534 295 aa8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 OLFM4Q6UX06 510 aa8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 DLK2Q6UY11 383 aa8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 TMC4Q7Z404 712 aa8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 JDP2Q8WYK2 163 aa8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 HTTP42858 3142 aa8.44□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 CDC14CA4D256 554 aa8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 SLC35F4A4IF30 521 aa8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 MYL6BP14649 208 aa8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 EIF6P56537 245 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 Q7L0L9 218 aa8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 SVOPQ8N4V2 548 aa8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 DEFB123Q8N688 67 aa8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 SUPT20HQ8NEM7 779 aa8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 RIC1Q4ADV7 1423 aa8.43□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 ITGA6P23229 1130 aa8.42□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 IARSP41252 1262 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.42□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.42□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 NGEFQ8N5V2 710 aa8.42□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 HYPKQ9NX55 129 aa8.42□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 BCORQ6W2J9 1755 aa8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 GDF11O95390 407 aa8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 GNAI1P63096 354 aa8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 TCIRG1Q13488 830 aa8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 SUSD4Q5VX71 490 aa8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 ADAM32Q8TC27 787 aa8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 DPF3Q92784 378 aa8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 TTC28Q96AY4 2481 aa8.41□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 FAM177BA6PVY3 158 aa8.4□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 GPR25O00155 361 aa8.4□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 NTSR2O95665 410 aa8.4□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 SV2AQ7L0J3 742 aa8.4□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.4□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 COPS6Q7L5N1 327 aa8.4□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 USP48Q86UV5 1035 aa8.4□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 SP8Q8IXZ3 490 aa8.4□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.4□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa8.4□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.4□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 SH3TC1Q8TE82 1336 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 FKTNO75072 461 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 GPTP24298 496 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 RAB15P59190 212 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 NEUROD2Q15784 382 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 C2orf69Q8N8R5 385 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 PRO3102Q9H379 93 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 IFT57Q9NWB7 429 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 TRIM17Q9Y577 477 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 SCN7AQ01118 1682 aa8.39□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 COL4A5P29400 1685 aa8.38□□□□□ -1.07
LAMA3-211ENST00000590104 AP1G2O75843 785 aa8.38□□□□□ -1.07
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