RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	AIDA	Q96BJ3	306 aa		30.06	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	ARMT1	Q9H993	441 aa		30.06	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	ENTPD3	O75355	529 aa		30.05	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	LCORL	Q8N3X6	602 aa		30.05	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	APPBP2	Q92624	585 aa		30.05	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	CREBZF	Q9NS37	354 aa		30.05	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		30.05	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	OTOF	Q9HC10	1997 aa		30.04	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	30.04	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	30.04	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	30.04	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	30.03	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		30.03	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	30.03	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	FZD1	Q9UP38	647 aa		30.03	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	FLT1	P17948	1338 aa		30.02	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	TEPSIN	Q96N21	525 aa		30.02	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	30.02	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	30.02	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	MOB2	Q70IA6	237 aa		30.01	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	CSRNP1	Q96S65	589 aa		30.01	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		30	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		30	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	OSBP2	Q969R2	916 aa		30	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	HOOK2	Q96ED9	719 aa		30	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229		M0R2C6	588 aa		29.99	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	29.99	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	HUNK	P57058	714 aa		29.99	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		29.99	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	SIPA1L1	O43166	1804 aa		29.99	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	MYH8	P13535	1937 aa		29.98	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	29.98	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		29.98	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		29.98	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	29.97	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	FKBP1B	P68106	108 aa		29.97	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	GRM1	Q13255	1194 aa		29.97	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		29.97	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	DCAF15	Q66K64	600 aa		29.97	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		29.97	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		29.97	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	LAMB1	P07942	1786 aa		29.96	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	29.96	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		29.96	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	GPAA1	O43292	621 aa		29.96	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	PRKAB2	O43741	272 aa		29.96	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	29.96	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	SDS	P20132	328 aa		29.96	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		29.96	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		29.96	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		29.96	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	29.96	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	29.95	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	PALD1	Q9ULE6	856 aa		29.95	■■■□□ 2.39
GPS1-223	ENST00000584229	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		29.94	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		29.94	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	FAM227B	Q96M60	508 aa		29.94	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		29.94	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0D9SFI3	127 aa		29.93	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	HIP1	O00291	1037 aa		29.93	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	HLA-DOA	P06340	250 aa		29.93	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		29.93	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		29.93	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		29.93	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	APP	P05067	770 aa		29.92	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		29.92	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	29.92	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	29.92	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		29.92	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	29.91	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	29.91	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	29.91	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	WRNIP1	Q96S55	665 aa		29.91	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	DOCK1	Q14185	1865 aa		29.91	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	FAM196B	A6NMK8	535 aa		29.9	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	GNAT2	P19087	354 aa		29.9	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	TICAM2	Q86XR7	235 aa		29.9	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		29.9	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	29.9	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		29.9	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	29.89	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		29.89	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	29.89	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		29.89	■■■□□ 2.38
GPS1-223	ENST00000584229	RASSF10	A6NK89	507 aa		29.88	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	SLURP2	P0DP57	97 aa		29.88	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	TDO2	P48775	406 aa		29.88	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		29.88	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	RGMB	Q6NW40	437 aa		29.88	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	TTC6	Q86TZ1	520 aa		29.87	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		29.87	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	CSAD	Q9Y600	493 aa		29.87	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	MAP3K11	Q16584	847 aa		29.86	■■■□□ 2.37
GPS1-223	ENST00000584229	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		29.86	■■■□□ 2.37

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