RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580515.5

TSPOAP1-AS1-206, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 980 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LRP2BPQ9P2M1 347 aa29.59■■■□□ 2.33
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa29.41■■■□□ 2.3
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C17orf99Q6UX52 265 aa29.4■■■□□ 2.3
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HTTP42858 3142 aa29.4■■■□□ 2.3
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DOCK1Q14185 1865 aa29.4■■■□□ 2.3
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