RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 TCF12Q99081 682 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 ANP32EQ9BTT0 268 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 LIN7BQ9HAP6 207 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 CRIM1Q9NZV1 1036 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 CLSPNQ9HAW4 1339 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PP55 124 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 TMPRSS2O15393 492 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 CLSTN1O94985 981 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 MPSTP25325 297 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 AFMP43652 599 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 AMIGO3Q86WK7 504 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 ASB11Q8WXH4 323 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 PLAGL2Q9UPG8 496 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 NPR3P17342 541 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 ID3Q02535 119 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 AAMPQ13685 434 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 GALNT12Q8IXK2 581 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 PSMD1Q99460 953 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 DUSP23Q9BVJ7 150 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 LMCD1Q9NZU5 365 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 SLAIN2Q9P270 581 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 CTNND2Q9UQB3 1225 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 U3KQE9 123 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 NFIBO00712 420 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 GLI1P08151 1106 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 ITPKAP23677 461 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF576Q9H609 170 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 DISC1Q9NRI5 854 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 LEFTY1O75610 366 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 FAM13AO94988 1023 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 ZP2Q05996 745 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 IKZF1Q13422 519 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 ECM1Q16610 540 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA0319Q5VV43 1072 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 ERICH6BQ5W0A0 696 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 MPZL3Q6UWV2 235 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 PRR23BQ6ZRT6 265 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 GJD3Q8N144 294 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 PRDM7Q9NQW5 492 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
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PTPRM-204ENST00000577468 C1QTNF9P0C862 333 aa4.27□□□□□ -1.73
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PTPRM-204ENST00000577468 ITIH2P19823 946 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 TTLL4Q14679 1199 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 FYB2Q5VWT5 728 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 KIRREL1Q96J84 757 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 KRT82Q9NSB4 513 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 FZD6O60353 706 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 NCLP19338 710 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
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PTPRM-204ENST00000577468 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 TOP6BLQ8N6T0 577 aa4.26□□□□□ -1.73
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PTPRM-204ENST00000577468 TMEM253P0C7T8 217 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
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PTPRM-204ENST00000577468 FAM214BQ7L5A3 538 aa4.25□□□□□ -1.73
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PTPRM-204ENST00000577468 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
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PTPRM-204ENST00000577468 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 INHBBP09529 407 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 PTMSP20962 102 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 RBM25P49756 843 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 CLCN7P51798 805 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 MTMR3Q13615 1198 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 CIAPIN1Q6FI81 312 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRM-204ENST00000577468 PBXIP1Q96AQ6 731 aa4.24□□□□□ -1.73
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