RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576346.5

NSF-208, Transcript of N-ethylmaleimide sensitive factor, vesicle fusing ATPase, human

TSL 4

Gene NSF, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSF-208	ENST00000576346	NOS2	P35228	1153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	DGKG	P49619	791 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	EPHA4	P54764	986 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	TEAD4	Q15561	434 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	DCTPP1	Q9H773	170 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	UTRN	P46939	3433 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	CHL1	O00533	1208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ERC2	O15083	957 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	MBD3	O95983	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	HMOX1	P09601	288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	FURIN	P09958	794 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	EPX	P11678	715 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PHKA2	P46019	1235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PLA2G4A	P47712	749 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ANAPC15	P60006	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	NME9	Q86XW9	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	COL26A1	Q96A83	441 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PEAK1	Q9H792	1746 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	CRB1	P82279	1406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	NCAPD2	Q15021	1401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PIK3R2	O00459	728 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	GNB5	O14775	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	BNIP3L	O60238	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	HOXB7	P09629	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ARAF	P10398	606 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	OCLN	Q16625	522 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	HIF1A	Q16665	826 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	C4orf17	Q53FE4	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	BTBD6	Q96KE9	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	HCN2	Q9UL51	889 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PIK3C2A	O00443	1686 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	MAP3K5	Q99683	1374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	C21orf2	O43822	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	GNAI2	P04899	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	FGFR3	P22607	806 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	MSX1	P28360	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	MCM5	P33992	734 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	CHRNA4	P43681	627 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	TERF1	P54274	439 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ZNF445	P59923	1031 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	CTBS	Q01459	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	FAM182B	Q5T319	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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