RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	CBX8	Q9HC52	389 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		6.11	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	TGFB1	P01137	390 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	RAB6A	P20340	208 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	ERVK-24	P63145	666 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	TTLL4	Q14679	1199 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	PAOX	Q6QHF9	649 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	SAMM50	Q9Y512	469 aa		6.1	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	SORBS3	O60504	671 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	LRRC14	Q15048	493 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	ZAR1	Q86SH2	424 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	GIPC2	Q8TF65	315 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		6.09	□□□□□ -1.43
COX11-208	ENST00000576084	WDR64	B1ANS9	1081 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	CD97	P48960	835 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	CDK8	P49336	464 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	LRP8	Q14114	963 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	MAP7	Q14244	749 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	INPP5A	Q14642	412 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	NBPF11	Q86T75	865 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	RNF214	Q8ND24	703 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	ISL2	Q96A47	359 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	CRELD1	Q96HD1	420 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		6.08	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	FAM170B	A6NMN3	283 aa		6.07	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		6.07	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	LIG3	P49916	1009 aa		6.07	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	PPM1J	Q5JR12	505 aa		6.07	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	C12orf40	Q86WS4	652 aa		6.07	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	FBXL6	Q8N531	539 aa		6.07	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	LGR6	Q9HBX8	967 aa		6.07	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		6.07	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	CSAD	Q9Y600	493 aa		6.07	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		6.06	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	MAP3K11	Q16584	847 aa		6.06	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		6.06	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		6.06	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	PHC3	Q8NDX5	983 aa		6.06	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		6.06	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		6.06	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		6.06	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		6.06	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	GFRA2	O00451	464 aa		6.05	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	ADAMTS4	O75173	837 aa		6.05	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	SPINK2	P20155	84 aa		6.05	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	SSTR4	P31391	388 aa		6.05	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	SEPT6	Q14141	434 aa		6.05	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		6.05	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		6.05	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	PIDD1	Q9HB75	910 aa		6.05	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		6.05	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	COBL	O75128	1261 aa		6.04	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	6.04	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	CDK5R2	Q13319	367 aa		6.04	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		6.04	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		6.04	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	PIM2	Q9P1W9	311 aa		6.04	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		6.04	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084		F6X3S4	739 aa		6.03	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	FANCG	O15287	622 aa		6.03	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	FOSL1	P15407	271 aa		6.03	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	6.03	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	MSMP	Q1L6U9	139 aa		6.03	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		6.03	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	DTX1	Q86Y01	620 aa		6.03	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	RHOV	Q96L33	236 aa		6.03	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		6.03	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		6.03	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		6.03	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	MRS2	Q9HD23	443 aa		6.03	□□□□□ -1.44
COX11-208	ENST00000576084	ATG3	Q9NT62	314 aa		6.03	□□□□□ -1.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms