RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.26■■□□□ 1.15
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INO80E-211ENST00000567987 ESR2Q92731 530 aa22.18■■□□□ 1.14
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INO80E-211ENST00000567987 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.18■■□□□ 1.14
INO80E-211ENST00000567987 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.18■■□□□ 1.14
INO80E-211ENST00000567987 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
INO80E-211ENST00000567987 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
INO80E-211ENST00000567987 MCM4P33991 863 aa22.18■■□□□ 1.14
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INO80E-211ENST00000567987 FOCADQ5VW36 1801 aa22.17■■□□□ 1.14
INO80E-211ENST00000567987 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.17■■□□□ 1.14
INO80E-211ENST00000567987 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
INO80E-211ENST00000567987 PLCD1P51178 756 aa22.17■■□□□ 1.14
INO80E-211ENST00000567987 PICALMQ13492 652 aa22.17■■□□□ 1.14
INO80E-211ENST00000567987 SENP2Q9HC62 589 aa22.17■■□□□ 1.14
INO80E-211ENST00000567987 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
INO80E-211ENST00000567987 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
INO80E-211ENST00000567987 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
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