RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYH1P12882 1939 aa22.35■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.34■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.34■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.34■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.34■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 RASA3Q14644 834 aa22.33■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIF3CO14782 793 aa22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 ENTPD3O75355 529 aa22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 SEC24BO95487 1268 aa22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM83AQ86UY5 434 aa22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM151AQ8WW52 585 aa22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNNI2P48788 182 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNFAIP1Q13829 316 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 DLK2Q6UY11 383 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 LDHDQ86WU2 507 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADM5C9JUS6 153 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 FGAP02671 866 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 TDO2P48775 406 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 EVX2Q03828 476 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 NAPBQ9H115 298 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 PALD1Q9ULE6 856 aa22.31■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP17L12C9JPN9 530 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP17L21D6R901 530 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP2D6P10635 497 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 ALX1Q15699 326 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 CTR9Q6PD62 1173 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP48Q86UV5 1035 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 SULF1Q8IWU6 871 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAP4K1Q92918 833 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMIM22K7EJ46 135 aa22.29■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 REC8O95072 547 aa22.28■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 TEPSINQ96N21 525 aa22.28■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 SIPA1L1O43166 1804 aa22.27■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLCD1P51178 756 aa22.27■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.27■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.27■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZMYM6O95789 1325 aa22.26■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 LAMB1P07942 1786 aa22.26■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.26■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLURP2P0DP57 97 aa22.26■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 SBK1Q52WX2 424 aa22.26■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 C12orf60Q5U649 245 aa22.26■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHADLQ6NUI6 762 aa22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 CSRNP1Q96S65 589 aa22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP26Q9BXU7 913 aa22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 BACH2Q9BYV9 841 aa22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.25■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 HAND2P61296 217 aa22.24■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTC6Q86TZ1 520 aa22.24■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.24■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 LAMA4Q16363 1823 aa22.24■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRAF5O00463 557 aa22.23■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPARAQ07869 468 aa22.23■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.23■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.23■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDCA5Q96FF9 252 aa22.23■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.23■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 HLA-DOAP06340 250 aa22.23■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.23■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 NECTIN1Q15223 517 aa22.23■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.23■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM196BA6NMK8 535 aa22.22■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF213O14771 459 aa22.22■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP21A2P08686 494 aa22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms