RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	BICD2	Q8TD16	824 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	AFF2	P51816	1311 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	PLSCR1	O15162	318 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	STK38	Q15208	465 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	RTN1	Q16799	776 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	OSBP2	Q969R2	916 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	CDC25B	P30305	580 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	REST	Q13127	1097 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	SWAP70	Q9UH65	585 aa		9.84	□□□□□ -0.83
RBM23-233	ENST00000557667	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	GGA1	Q9UJY5	639 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	CUTA	O60888	179 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	ADAL	Q6DHV7	355 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	SP8	Q8IXZ3	490 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	ANKS1A	Q92625	1134 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	MBD4	O95243	580 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	PPARA	Q07869	468 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	LAD1	O00515	517 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	COA1	Q9GZY4	146 aa		9.83	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	NPR1	P16066	1061 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	DGKH	Q86XP1	1220 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	MYL1	P05976	194 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	ADORA1	P30542	326 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	ERFE	Q4G0M1	354 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	PHKA1	P46020	1223 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	TTC6	Q86TZ1	520 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	FERMT2	Q96AC1	680 aa		9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	TXLNA	P40222	546 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	RASGRF1	Q13972	1273 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	SMC2	O95347	1197 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	SCRN1	Q12765	414 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	STYK1	Q6J9G0	422 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667		A0A1B0GUL6	1792 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		9.81	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	GSDMD	P57764	484 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	OLFM4	Q6UX06	510 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	CMA1	P23946	247 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	ALG1	Q9BT22	464 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	GINM1	Q9NU53	330 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	MTMR7	Q9Y216	660 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	SBF2	Q86WG5	1849 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	CRY2	Q49AN0	593 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	LAMB1	P07942	1786 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	FIBP	O43427	364 aa		9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
RBM23-233	ENST00000557667	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84

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