RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.51■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 CREBZFQ9NS37 354 aa21.51■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.5■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 RHBDL3P58872 404 aa21.5■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 NFIAQ12857 509 aa21.49■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 CASC1Q6TDU7 716 aa21.49■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.49■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 CSRNP1Q96S65 589 aa21.49■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.49■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.48■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 ARMT1Q9H993 441 aa21.48■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.48■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.48■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 FLT1P17948 1338 aa21.48■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.48■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 CNTNAP1P78357 1384 aa21.48■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 APPP05067 770 aa21.47■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.47■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 TTC6Q86TZ1 520 aa21.47■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.47■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.47■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 OTOFQ9HC10 1997 aa21.47■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.46■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 LCORLQ8N3X6 602 aa21.46■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.46■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
BRF1-209ENST00000547052 GPAA1O43292 621 aa21.45■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 SDSP20132 328 aa21.45■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 HUNKP57058 714 aa21.45■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.45■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.45■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 CSADQ9Y600 493 aa21.45■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.45■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 DOCK1Q14185 1865 aa21.44■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 UNCXA6NJT0 531 aa21.44■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 PRKG1Q13976 671 aa21.44■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.44■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.44■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 ECE1P42892 770 aa21.43■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 TDO2P48775 406 aa21.43■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.43■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 CST9Q5W186 159 aa21.43■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 OSBP2Q969R2 916 aa21.43■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 TEPSINQ96N21 525 aa21.43■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.42■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.42■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.42■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 RAD50Q92878 1312 aa21.42■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.42■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.42■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 M0R2C6 588 aa21.41■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.41■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.41■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.4■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.4■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 DLK2Q6UY11 383 aa21.4■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.4■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 WRNIP1Q96S55 665 aa21.4■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 NAPBQ9H115 298 aa21.4■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.4■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 PALD1Q9ULE6 856 aa21.4■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 SIPA1L1O43166 1804 aa21.4■■□□□ 1.02
BRF1-209ENST00000547052 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 MAP3K11Q16584 847 aa21.39■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 RGMBQ6NW40 437 aa21.39■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 CCDC102AQ96A19 550 aa21.39■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.39■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.39■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 A0A0D9SFI3 127 aa21.38■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 TBC1D12O60347 775 aa21.38■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
BRF1-209ENST00000547052 MAP3K9P80192 1104 aa21.38■■□□□ 1.01
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