RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD8-204ENST00000544999 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-204ENST00000544999 RAB11FIP3O75154 756 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-204ENST00000544999 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-204ENST00000544999 ZAP70P43403 619 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-204ENST00000544999 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-204ENST00000544999 ABHD8Q96I13 439 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-204ENST00000544999 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-204ENST00000544999 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-204ENST00000544999 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 GTF2A2P52657 109 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 DGKZQ13574 1117 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 ERO1BQ86YB8 467 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 OTUD5Q96G74 571 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 RNF39Q9H2S5 420 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 GPR25O00155 361 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 INPP5BP32019 993 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 PICALMQ13492 652 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 APBB1O00213 710 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 BAG3O95817 575 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 MAP3K10Q02779 954 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 PPATQ06203 517 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 PPIL2Q13356 520 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 PTPN18Q99952 460 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 PLCG2P16885 1265 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 CCL15Q16663 113 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 TEX11Q8IYF3 940 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 IRF6O14896 467 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 FKTNO75072 461 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 PPP4CP60510 307 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
HOXD8-204ENST00000544999 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 CETPP11597 493 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 SNAPC2Q13487 334 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 TBC1D12O60347 775 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 CRHR2Q13324 411 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 FOCADQ5VW36 1801 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 CYP7A1P22680 504 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 MAP3K12Q12852 859 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 DOCK1Q14185 1865 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 CERS3Q8IU89 383 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 PICK1Q9NRD5 415 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 FLT1P17948 1338 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 BTBD19C9JJ37 291 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 SLURP2P0DP57 97 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 CXCL11O14625 94 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 PTPRAP18433 802 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 ERO1AQ96HE7 468 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 BCL11AQ9H165 835 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 DCTPP1Q9H773 170 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXD8-204ENST00000544999 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms