RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		18.34	■□□□□ 0.53
BBS1-224	ENST00000534730	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		18.34	■□□□□ 0.53
BBS1-224	ENST00000534730	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		18.34	■□□□□ 0.53
BBS1-224	ENST00000534730	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	18.34	■□□□□ 0.53
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
BBS1-224	ENST00000534730	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		18.34	■□□□□ 0.53
BBS1-224	ENST00000534730	CA12	O43570	354 aa		18.33	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	ENTPD3	O75355	529 aa		18.33	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		18.33	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		18.33	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	TEX11	Q8IYF3	940 aa		18.33	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	IDI2	Q9BXS1	227 aa		18.33	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		18.33	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	GGA3	Q9NZ52	723 aa		18.33	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		18.33	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	CDC45	O75419	566 aa		18.32	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	NF2	P35240	595 aa		18.32	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	USP5	P45974	858 aa		18.32	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		18.32	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		18.32	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	USP48	Q86UV5	1035 aa		18.32	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		18.32	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	VEZT	Q9HBM0	779 aa		18.32	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		18.32	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF384	Q8TF68	577 aa		18.31	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	MBD4	O95243	580 aa		18.3	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		18.3	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		18.3	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		18.3	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		18.3	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	CLRN2	A0PK11	232 aa		18.29	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	GPAA1	O43292	621 aa		18.29	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	RHBDL3	P58872	404 aa		18.29	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	NOG	Q13253	232 aa		18.29	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	FAM151A	Q8WW52	585 aa		18.29	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		18.28	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	HLA-DOA	P06340	250 aa		18.28	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	CHML	P26374	656 aa		18.28	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	HUNK	P57058	714 aa		18.28	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	TTC6	Q86TZ1	520 aa		18.28	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	OSBP2	Q969R2	916 aa		18.28	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		18.28	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		18.28	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		18.27	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	ADM5	C9JUS6	153 aa		18.27	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	APP	P05067	770 aa		18.27	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		18.27	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
BBS1-224	ENST00000534730	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		18.26	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	RASA3	Q14644	834 aa		18.26	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	DCAF15	Q66K64	600 aa		18.26	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		18.26	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	ARMT1	Q9H993	441 aa		18.26	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		18.26	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	DGKZ	Q13574	1117 aa		18.25	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	RGMB	Q6NW40	437 aa		18.25	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	LCORL	Q8N3X6	602 aa		18.25	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		18.25	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		18.25	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		18.25	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730		A0A0D9SFI3	127 aa		18.24	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	REC8	O95072	547 aa		18.24	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	NT5C2	P49902	561 aa		18.24	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	PICALM	Q13492	652 aa		18.24	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	FAM227B	Q96M60	508 aa		18.24	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		18.24	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	NAPB	Q9H115	298 aa		18.24	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		18.24	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	FLT1	P17948	1338 aa		18.23	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		18.23	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730		M0R2C6	588 aa		18.23	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	TDO2	P48775	406 aa		18.23	■□□□□ 0.51
BBS1-224	ENST00000534730	FKBP1B	P68106	108 aa		18.23	■□□□□ 0.51

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