RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528987.1

CD59-211, Transcript of CD59 molecule (CD59 blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD59, Length 3,716 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD59-211ENST00000528987 GRM3Q14832 879 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 GK5Q6ZS86 529 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 PACS2Q86VP3 889 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 TNIP3Q96KP6 325 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 FOXO3O43524 673 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 A0A087X0B3 334 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 INMTO95050 263 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 PDGFAP04085 211 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 CCND1P24385 295 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 PTPRMP28827 1452 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.53□□□□□ -1.36
CD59-211ENST00000528987 MT-CO1P00395 513 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 ATICP31939 592 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 DGKZQ13574 1117 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 ARL10Q8N8L6 244 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 APOL5Q9BWW9 433 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 ATP10AO60312 1499 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 PLCG2P16885 1265 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 IGFBP4P22692 258 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 POF1BQ8WVV4 589 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 RRN3Q9NYV6 651 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 KCNQ2O43526 872 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 KPNA6O60684 536 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 PPFIA3O75145 1194 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.372e-6■■□□□ 14.3
CD59-211ENST00000528987 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 ABTB2Q8N961 1025 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 SHDQ96IW2 340 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 PF4V1P10720 104 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 ADCY1Q08828 1119 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 TM4SF20Q53R12 229 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 OCEL1Q9H607 264 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 ZFATQ9P243 1243 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 FAM153BP0C7A2 387 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 RASGRF1Q13972 1273 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 PJA1Q8NG27 643 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 NELL1Q92832 810 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 BCO2Q9BYV7 579 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 A0A1W2PRQ8 180 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 MBD4O95243 580 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 RNF180Q86T96 592 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 GJD3Q8N144 294 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 FBXO27Q8NI29 283 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa6.51□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.5□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 MYBL2P10244 700 aa6.5□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 KRT20P35900 424 aa6.5□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 NEK4P51957 841 aa6.5□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.5□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.5□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.5□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 RPAINQ86UA6 219 aa6.5□□□□□ -1.37
CD59-211ENST00000528987 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms